1936年1月19日生于塞爾維亞南部科索沃自治省的賈科維察。阿爾巴尼亞族人。1948年加入南斯拉夫共產(chǎn)主義青年聯(lián)盟（共青團(tuán)），1957年加入南斯拉夫共產(chǎn)主義者聯(lián)盟。貝爾格萊德高等政治科學(xué)院研究生畢業(yè)。20世紀(jì)50年代曾任普里什蒂納大學(xué)哲學(xué)院講師、貝爾格萊德塞爾維亞航空公司聯(lián)邦理事會組織書記、普里茲倫紡織廠共盟委員會書記、普里茲倫市共產(chǎn)主義青年聯(lián)盟委員會主席。1961——1967年任科索沃自治省共產(chǎn)主義青年聯(lián)盟委員會主席，先后當(dāng)選為塞爾維亞共產(chǎn)主義青年聯(lián)盟中央主席團(tuán)委員和南斯拉夫共產(chǎn)主義青年聯(lián)盟中央委員會委員。1967——1971年任共盟普里什蒂納市委員會主席，1968年當(dāng)選為塞爾維亞共產(chǎn)主義者聯(lián)盟中央委員會委員。1971年6月28日——1981年5月6日任共產(chǎn)主義者聯(lián)盟科索沃省委主席。1974年當(dāng)選為塞爾維亞共盟中央主席團(tuán)委員。1974年5月南共聯(lián)盟“十大”、1978年7月南共聯(lián)盟“十一大”當(dāng)選為南共聯(lián)盟中央委員、中央主席團(tuán)委員。

馬赫穆特·巴卡利是一位學(xué)者，參加過許多學(xué)術(shù)研討會議，發(fā)表和出版過多部社會科學(xué)領(lǐng)域的專著。但他的志向是進(jìn)入政壇，20世紀(jì)60年代，南共聯(lián)盟終身主席、南斯拉夫聯(lián)邦終身總統(tǒng)約瑟普·布羅茲·鐵托元帥推行的權(quán)力下放政策，他在1961年成為科索沃共青團(tuán)領(lǐng)導(dǎo)人，1971年，年僅35歲的巴卡利接任科索沃省共盟主席一職，并進(jìn)入南共聯(lián)盟主席團(tuán)，成為南共聯(lián)盟一位“少壯派”領(lǐng)導(dǎo)人。

巴卡利在短短十年內(nèi)迅速上升到科索沃黨政最高領(lǐng)導(dǎo)人的地位，其一，他對共產(chǎn)黨的官僚機(jī)構(gòu)內(nèi)部運(yùn)作的了解；其二，他在貝爾格萊德接受高等教育的背景，受到塞族領(lǐng)導(dǎo)人的信任；其三，他來自科索沃西南部的賈科維察地區(qū)，是法迪利·霍扎等牢牢掌握科索沃權(quán)力的阿爾巴尼亞族政治家的“大本營”。

在巴卡利主政科索沃期間，被認(rèn)為是科索沃最穩(wěn)定的時(shí)期，阿爾巴尼亞族人的地位和待遇都得到了提高和改善。正是在“賈科維察幫”積極游說下，鐵托在20世紀(jì)70年代初期作出科索沃自治權(quán)的升級的決定，1974年的《南斯拉夫社會主義聯(lián)邦共和國憲法》擴(kuò)大了科索沃的自治權(quán)。盡管它仍然是塞爾維亞共和國的一個(gè)自治省，但它也獲得了相對平等的南斯拉夫聯(lián)邦主體的地位，在南共聯(lián)盟中央主席團(tuán)和南斯拉夫聯(lián)邦主席團(tuán)等中央黨政機(jī)構(gòu)，也都有科索沃的代表。理論上，它具有與塞爾維亞相同的表決權(quán)。同時(shí)，科索沃還得到了南斯拉夫設(shè)立的援助不發(fā)達(dá)地區(qū)基金的財(cái)政援助和幫扶，經(jīng)濟(jì)和文化建設(shè)有了較大發(fā)展。

1980年鐵托總統(tǒng)逝世后，長期被壓制的科索沃問題開始演變成科索沃危機(jī)。1981年3月11日，在科索沃的首府普里什蒂納，發(fā)生了阿爾巴尼亞族大學(xué)生因?qū)W校食堂伙食質(zhì)量問題而舉行示威游行的事件。后來事態(tài)擴(kuò)大，蔓延到周圍城鎮(zhèn)，并演變成政治事件。示威者要求將自治省升格為共和國，提出“要科索沃共和國不要自治省”、“我們是阿爾巴尼亞人而不是南斯拉夫人”等激進(jìn)口號，進(jìn)而又提出脫離聯(lián)邦與阿爾巴尼亞合并。當(dāng)局一改以往政治勸導(dǎo)為主的方式，不再像鐵托時(shí)代那樣尋求妥協(xié)，而是拒絕對話，派軍警和坦克去維持秩序，與示威者發(fā)生沖突，造成傷亡。事態(tài)雖然被平息，但此后，科索沃幾乎再無寧日。普里什蒂納官方報(bào)紙《再生報(bào)》1987年7月1日報(bào)道說：“1981～1986年間，15萬多科索沃人受到過警察詢問；5萬多人受到過懲罰或譴責(zé)；7000多人被捕入獄( 包括近千名未成年人)；1234人被判處20年徒刑。同一時(shí)期，在有40多萬阿爾巴尼亞人居住的馬其頓，有1300多人被監(jiān)禁�！�

在事件中，馬赫穆特·巴卡利與以拉赫曼·莫里納（科索沃自治省內(nèi)務(wù)部長）為首的親塞爾維亞的強(qiáng)硬派在處理阿族人鬧事問題的方式上發(fā)生嚴(yán)重分歧。南共聯(lián)盟和聯(lián)邦中央嚴(yán)厲批評霍扎、巴卡利等科索沃主要領(lǐng)導(dǎo)，指責(zé)他們對騷亂缺乏警惕和應(yīng)對，對事件負(fù)有“政治責(zé)任”。1981年5月，巴卡利被迫提出辭職。塞爾維亞宣布科索沃戒嚴(yán)并全面清洗科索沃黨政領(lǐng)導(dǎo)層，巴卡利被開除黨籍并被軟禁了兩年。之后，他被允許在科索沃省科學(xué)協(xié)會工作，直到退休。

南斯拉夫解體后，科索沃危機(jī)日益加劇，巴卡利作為科索沃的資深政治活動家，對南斯拉夫和塞爾維亞政治體制有深入的了解，因此受到科索沃阿爾巴尼亞族領(lǐng)導(dǎo)人的倚重。1998年5月，巴卡利陪同易卜拉欣·魯戈瓦等科索沃阿族領(lǐng)導(dǎo)人前往貝爾格萊德，與斯洛博丹·米洛舍維奇總統(tǒng)就和平解決科索沃沖突問題進(jìn)行談判，1999年初參加了在法國朗布依埃召開的由國際社會斡旋的科索沃問題國際會議。

2001年起，巴卡利當(dāng)選為科索沃議會議員。2002年前南斯拉夫問題國際刑事法庭審判米洛舍維奇時(shí)，曾作為證人出庭作證。2003年3月任科索沃臨時(shí)政府總理阿吉姆·切庫的顧問。

2006年4月14日，馬赫穆特·巴卡利因患肺癌病逝于普里什蒂納，享年70歲。

馬赫穆特·巴卡利曾榮獲南斯拉夫一級各民族兄弟團(tuán)結(jié)和友誼勛章和二級軍功勛章。