宋亡之后,熊禾誓不仕元,"遂束書入武夷山"(清·董天工《武夷山志》),在五曲晚對(duì)峰構(gòu)筑隱居學(xué)習(xí)的"洪源書室"。隱居之初，以其崇高的氣節(jié)和精深的學(xué)識(shí)吸引了一大批學(xué)者和文士,人們尊其為師長(zhǎng),同其研討義理。為此，熊禾開始在書室講學(xué)。"四方來(lái)學(xué)者云集,糲食澗飲，日以孔孟之道相磨石龍。"(民國(guó)《崇安縣新志》)因而盛譽(yù)天下。當(dāng)時(shí)的學(xué)者名流，諸如胡庭芳、詹君履等人都曾特來(lái)拜訪，而求學(xué)者更多得難以計(jì)數(shù)。熊禾為此著手改建書室，將"洪源書室"擴(kuò)建為"洪源書院"。胡庭芳雖為易學(xué)大家,造詣?lì)H深,名重一方，但也經(jīng)常到洪源書院與熊禾論道。熊禾亦有多篇文字送胡庭芳，闡發(fā)自己的理學(xué)精要。熊禾十分敬仰朱熹。他在卜居武夷山的12年中，通覽朱子諸書,選擇其中精要者輯為一冊(cè)《文公要語(yǔ)》,為人們研習(xí)朱熹的思想、理論,提供了極有益的幫助。在洪源書院期間,熊禾還分別上《重修武夷書院疏》、《重建朱文公神道門疏》，以期弘揚(yáng)朱子之學(xué)。

熊禾居武夷12年,回到家鄉(xiāng)建陽(yáng)熊墩,在鰲峰之麓重建鰲峰書院，講學(xué)著述,以奉先圣,繼承理學(xué)道統(tǒng)。因書院門對(duì)云谷，改稱云谷書院，四方學(xué)者接踵而至。

熊禾是朱熹的三傳弟子,深受其學(xué)說(shuō)影響,視朱熹為孔子之二,認(rèn)為朱熹的著述繼往圣絕學(xué),開萬(wàn)世太平，其學(xué)術(shù)影響，關(guān)系到國(guó)家存亡，民心向背。有"宇宙間三十六名山，地未有如武夷之勝；孔孟后千五百余載，道未有如文公之尊"之句(清《武夷山志·重建武夷書院疏》)。熊禾對(duì)朱熹的評(píng)價(jià)，得到后人的贊同，為朱熹在儒家道統(tǒng)中奠定崇高的地位。

熊禾以畢生精力研究儒家經(jīng)典，繼承、弘揚(yáng)和發(fā)展了朱子理學(xué),成為著名理學(xué)家、教育家,后人稱譽(yù)："朱熹有功于圣門,熊禾有功于朱熹"。著有《易經(jīng)講義》、《易學(xué)圖存》、《周易集疏》、《書說(shuō)》、《大學(xué)尚書口義》、《三禮考略》、《春秋通解》、《春秋論考》、《四書標(biāo)題》、《大學(xué)廣義》、《四書小學(xué)集疏》、《文公要語(yǔ)》等。