民國14年7月畢業(yè)于國立廣東大學(xué)(農(nóng)業(yè)專門學(xué)校于民國13年9月并入廣東大學(xué))農(nóng)學(xué)專門部農(nóng)藝系畜牧門。在校學(xué)習(xí)期間，是學(xué)生會(huì)主辦的學(xué)術(shù)刊物《農(nóng)聲》主要撰稿人之一，為校長鄒魯所賞識。畢業(yè)后，留校升入本科。民國15年2月，被派往法國里昂大學(xué)醫(yī)學(xué)院專攻醫(yī)學(xué)，并得博士學(xué)位。 　民國20年(1931)，在里昂公立醫(yī)院公開應(yīng)試，成為該院助理醫(yī)師。不久，被分派至里昂各公立醫(yī)院任職。民國23年回國，任國立中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院內(nèi)科教授，兼附屬第一醫(yī)院院長。民國27年，廣州淪陷，率中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院人員往廣寧設(shè)立傷兵醫(yī)院(后改名為后方醫(yī)院)。同年，在昆明任云南大學(xué)教授兼醫(yī)學(xué)院院長。在其離開中大醫(yī)學(xué)院期間，一度曾在法國人開設(shè)的甘美醫(yī)院任醫(yī)師。此時(shí)，他感到必須自己創(chuàng)業(yè)。于是，先在昆明南屏街設(shè)立診所，于民國30年擴(kuò)大為碧澄醫(yī)院。他在云南從醫(yī)從教達(dá)9年之久，遠(yuǎn)近聞名，前來求醫(yī)者甚眾，每日不下200余人。 　抗戰(zhàn)結(jié)束后，姚碧澄于民國36年(1947)2月回到廣州，在太平北路開設(shè)碧澄醫(yī)院。1951年，公私合營，碧澄醫(yī)院自動(dòng)停業(yè)，任廣州市立醫(yī)院院長。不久，市立醫(yī)院與市方便醫(yī)院合并，擴(kuò)大為廣州市人民醫(yī)院，姚碧澄將其汽車及原碧澄醫(yī)院的醫(yī)療器械全部獻(xiàn)給市人民醫(yī)院。市醫(yī)院分為兩間，姚碧澄為第一醫(yī)院院長兼內(nèi)科主任。1954年，任廣州市衛(wèi)生局副局長，仍兼市第一醫(yī)院院長。1956年被選為廣州市人民代表大會(huì)代表及廣州市科協(xié)副主席。1958年。負(fù)責(zé)創(chuàng)辦廣州醫(yī)學(xué)院兼任院長。1963年，率廣東醫(yī)學(xué)考察團(tuán)到梅縣地區(qū)考察�；氐郊亦l(xiāng)時(shí)，建議新辟縣人民醫(yī)院門診部，得到縣人民政府的采納與實(shí)施。他不但精于內(nèi)科、小兒科，更精于奇難雜癥的治療�；剜l(xiāng)期間，適值一位患子宮癌的婦女急需動(dòng)手術(shù)，因當(dāng)年平遠(yuǎn)醫(yī)院設(shè)備簡陋，他不顧旅途勞頓，與當(dāng)時(shí)平遠(yuǎn)醫(yī)院院長李文鐸一起把病人帶到梅縣地區(qū)醫(yī)院，親自主持開刀動(dòng)手術(shù)達(dá)8小時(shí)之久，使病者得到及時(shí)治療而康復(fù)延壽。 　姚碧澄著述有《內(nèi)科學(xué)》上下冊，原稿近百萬字，未及付梓，惜在“文化大革命”中被“紅衛(wèi)兵”抄家，全部散失無蹤。1966年8月，姚碧澄在“紅衛(wèi)兵”的揪斗聲中悲憤自盡。中共十一屆三中全會(huì)后，有關(guān)部門為他平反昭雪，恢復(fù)名譽(yù)。

西醫(yī)名家。建國后，姚碧澄個(gè)人捐資舊人民幣一億元及小汽車一部和碧澄醫(yī)院全部設(shè)備創(chuàng)建廣州市第一人民醫(yī)院并成創(chuàng)始院長、廣州醫(yī)學(xué)院創(chuàng)始院長，是平遠(yuǎn)籍除黃梅興將軍以外建國后在外地迄今唯一一個(gè)被后人鑄銅像紀(jì)念銘懷的先輩，被評為平遠(yuǎn)四杰之一。今廣州東風(fēng)西路有鐘南山院士親書的“碧澄賓館”，廣州市第一人民醫(yī)院內(nèi)有銅像紀(jì)念。