溥澤除長經(jīng)史之外，尤愛研讀醫(yī)書，中年之后，潛心醫(yī)學(xué)研究。他認(rèn)為中國古代醫(yī)學(xué)源遠(yuǎn)流長，既有精深的理論體系，又積累了豐富的臨床經(jīng)驗(yàn)。對《素問》、《靈樞》、《傷寒論》、《金匱》等經(jīng)典醫(yī)學(xué)名著，都有深入的研討，并且親自臨床，不避辛勞，常為百姓解除疾苦。綜合自己的理論研究和實(shí)踐，除考訂了許多古代醫(yī)書，還撰寫了《醫(yī)學(xué)詩話》《云巢醫(yī)案》《傷寒指南》等醫(yī)學(xué)專著。至今尚有《要略厘辭》傳世，在國圖、北京中醫(yī)藥大學(xué)圖書館及中國中醫(yī)科學(xué)院圖書館均有藏，為醫(yī)家所重視。

于溥澤醫(yī)術(shù)高明，善治疑難之癥，且樂于授徒。近200年來，平度西鄉(xiāng)多醫(yī)，與他的傳授與影響關(guān)系很大。

清嘉慶九年（1804年），于溥澤病卒于家鄉(xiāng)。