DNA雙螺旋模型的發(fā)現(xiàn)歷程
三個實驗室的競爭 20世紀40年代末和50年代初,在DNA被確認為遺傳物質(zhì)之后,生物學(xué)家 詹姆斯·沃森 們不得不面臨著一個難題:DNA應(yīng)該有什么樣的結(jié)構(gòu),才能擔當遺傳的重任?它必須能夠攜帶 遺傳信息,能夠自我復(fù)制傳遞遺傳信息,能夠讓遺傳信息得到表達以控制細胞活動,并且能夠突變并保留突變。這4點,缺一不可,如何建構(gòu)一個DNA分子模型解釋這一切?
當時主要有三個實驗室?guī)缀跬瑫r在研究DNA分子模型。第一個實驗室是 倫敦國王學(xué)院的威爾金斯、弗蘭克林實驗室,他們用X 射線 衍射法研究DNA的晶體結(jié)構(gòu)。當X射線照射到生物大分子的晶體時,晶格中的原子或分子會使射線發(fā)生偏轉(zhuǎn),根據(jù)得到的衍射圖像,可以推測分子大致的結(jié)構(gòu)和形狀。第二個實驗室是 加州理工學(xué)院的大化學(xué)家萊納斯·鮑林(Linus Pauling)實驗室。在此之前, 沃森 鮑林已發(fā)現(xiàn)了 蛋白質(zhì)的a螺旋結(jié)構(gòu)。第三個則是個非正式的研究小組,事實上他們可說是不務(wù)正業(yè)。23歲的年輕的遺傳學(xué)家沃森于1951年從美國到 劍橋大學(xué)做博士后時,雖然其真實意圖是要研究DNA分子結(jié)構(gòu),掛著的課題項目卻是研究 煙草花葉病毒。比他年長12歲的克里克當時正在做 博士論文,論文題目是“多肽和蛋白質(zhì):X射線研究”。沃森說服與他分享同一個辦公室的克里克一起研究DNA分子模型,他需要克里克在X射線 晶體衍射學(xué)方面的知識。他們從1951年10月開始拼湊模型,幾經(jīng)嘗試,終于在1953年3月獲得了正確的模型。關(guān)于這三個實驗室如何明爭暗斗,互相競爭,由于沃森一本風靡全球的自傳《雙螺旋》而廣為人知。值得探討的一個問題是:為什么沃森和克里克既不像威爾金斯和弗蘭克林那樣 沃森博士 擁有第一手的實驗資料,又不像鮑林那樣有建構(gòu)分子模型的豐富經(jīng)驗(他們兩個人都是第一次建構(gòu)分子模型),卻能在這場競賽中獲勝?
這些人中,除了沃森,都不是遺傳學(xué)家,而是 物理學(xué)家或化學(xué)家。威爾金斯雖然在1950年最早研究DNA的晶體結(jié)構(gòu),當時卻對DNA究竟在細胞中干什么一無所知,在1951年才覺得DNA可能參與了核蛋白所控制的遺傳。弗蘭克林也不了解DNA在生物細胞中的重要性。鮑林研究DNA分子,則純屬偶然。他在1951年11月的《美國化學(xué)學(xué)會雜志》上看到一篇 核酸結(jié)構(gòu)的論文,覺得荒唐可笑,為了反駁這篇論文,才著手建立DNA分子模型。他是把DNA分子當作化合物,而不是遺傳物質(zhì)來研究的。這兩個研究小組完全根據(jù)晶體衍射圖建構(gòu)模型,鮑林甚至根據(jù)的是30年代拍攝的模糊不清的衍射照片。不理解DNA的 生物學(xué)功能,單純根據(jù)晶體衍射圖,有太多的可能性供選擇,是很難得出正確的模型的。
堅信DNA為遺傳物質(zhì) 沃森在1951年到 劍橋之前,曾經(jīng)做過用同位素標記追蹤噬菌體DNA的實驗,堅信DNA就是遺傳物質(zhì)。據(jù)他的回憶,他到劍橋后發(fā)現(xiàn)克里克也是“知道DNA比蛋白質(zhì)更為重要的人”。但是按克里克本人的說法,他當時對DNA所知不多,并未覺得它在遺傳上比蛋白質(zhì)更重要,只是認為DNA作為與核蛋白結(jié)合的物質(zhì),值得研究。對一名研究生來說,確定一種未知分子的結(jié)構(gòu),就是一個值得一試的課題。在確信了DNA是遺傳物質(zhì)之后,還必須理解遺傳物質(zhì)需要什么樣的性質(zhì)才能發(fā)揮基因的功能。像克里克和威爾金斯,沃森后來也強調(diào)薛定諤的《 生命是什么?》一書對他的重要影響,他甚至說他在芝加哥大學(xué)時讀了這本書之后,就立志要破解基因的奧秘。如果這是真的,我們就很難明白,為什么沃森向 印第安那大學(xué)申請研究生時,申請的是鳥類學(xué)。由于印第安那大學(xué)動物系沒有鳥類學(xué)專業(yè),在系主任的建議下,沃森才轉(zhuǎn)而從事遺傳學(xué)研究。當時大遺傳學(xué)家赫爾曼·繆勒(Hermann Muller)恰好正在印第安那大學(xué)任教授,沃森不僅上過繆勒關(guān)于“突變和基因”的課(分數(shù)得A),而且考慮過要當他的研究生。但覺得繆勒研究的果蠅在遺傳學(xué)上已過了輝煌時期,才改拜研究噬菌體遺傳的薩爾瓦多·盧里亞(Salvador Luria)為師。但是,繆勒關(guān)于遺傳物質(zhì)必須具有自催化、異催化和突變?nèi)匦缘挠^念,想必對沃森有深刻的影響。正是因為沃森和克里克堅信DNA是遺傳物質(zhì),并且理解遺傳物質(zhì)應(yīng)該有什么樣的特性,才能根據(jù)如此少的數(shù)據(jù),做出如此重大的發(fā)現(xiàn)。
DNA之父 他們根據(jù)的數(shù)據(jù)僅有三條:第一條是當時已廣為人知的,即DNA由6種小分子組成:脫氧核糖,磷酸和4種堿基(A、G、T、C),由這些小分子組成了4種核苷酸,這4種核苷酸組成了DNA.第二條證據(jù)是最新的,弗蘭克林得到的衍射照片表明,DNA是由兩條長鏈組成的雙螺旋,寬度為20埃。第三條證據(jù)是最為關(guān)鍵的。美國生物化學(xué)家埃爾文·查戈夫(Erwin Chargaff)測定DNA的分子組成,發(fā)現(xiàn)DNA中的4種堿基的含量并不是傳統(tǒng)認為的等量的,雖然在不同物種中4種堿基的含量不同,但是A和T的含量總是相等,G和C的含量也相等。
得到正確模型 查加夫早在1950年就已發(fā)布了這個重要結(jié)果,但奇怪的是,研究DNA分子結(jié)構(gòu)的這三個實驗室都將它忽略了。甚至在查加夫1951年春天親訪劍橋,與沃森和克里克見面后,沃森和克里克對他的結(jié)果也不加重視。在沃森和克里克終于意識到查加夫比值的重要性,并請劍橋的青年數(shù)學(xué)家約翰·格里菲斯(John Griffith)計算出A吸引T,G吸引C,A+T的寬度與G+C的寬度相等之后,很快就拼湊出了DNA分子的正確模型。
沃森和克里克在1953年4月25日的《自然》雜志上以1000多字和一幅插圖的短文公布了他們的發(fā)現(xiàn) 沃森 。在論文中,沃森和克里克以謙遜的筆調(diào),暗示了這個結(jié)構(gòu)模型在遺傳上的重要性:“我們并非沒有注意到,我們所推測的特殊配對立即暗示了遺傳物質(zhì)的復(fù)制機理!痹陔S后發(fā)表的論文中,沃森和克里克詳細地說明了 DNA雙螺旋模型對遺傳學(xué)研究的重大意義:一、它能夠說明遺傳物質(zhì)的自我復(fù)制。這個“ 半保留復(fù)制”的設(shè)想后來被馬修·麥賽爾遜(Matthew Meselson)和富蘭克林·斯塔勒(Franklin W.Stahl)用同位素追蹤實驗證實。二、它能夠說明遺傳物質(zhì)是如何攜帶遺傳信息的。三、它能夠說明基因是如何突變的;蛲蛔兪怯捎趬A基序列發(fā)生了變化,這樣的變化可以通過復(fù)制而得到保留。
但是遺傳物質(zhì)的第四個特征,即遺傳信息怎樣得到表達以控制細胞活動呢?這個模型無法解釋,沃森和克里克當時也公開承認他們不知道DNA如何能“對細胞有高度特殊的作用”。不過,這時,基因的主要功能是控制蛋白質(zhì)的合成,這種觀點已成為一個共識。那么基因又是如何控制蛋白質(zhì)的合成呢?有沒有可能以DNA為模板,直接在DNA上面將氨基酸連接成蛋白質(zhì)?在沃森和克里克提出DNA雙螺旋模型后的一段時間內(nèi),即有人如此假設(shè),認為DNA結(jié)構(gòu)中,在不同的堿基對之間形成形狀不同的“窟窿”,不同的氨基酸插在這些窟窿中,就能連成特定序列的蛋白質(zhì)。但是這個假說,面臨著一大難題:染色體DNA存在于細胞核中,而絕大多數(shù)蛋白質(zhì)都在細胞質(zhì)中,細胞核和細胞質(zhì)由大分子無法通過的核膜隔離開,如果由DNA直接合成蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)無法跑到細胞質(zhì)。另一類核酸RNA倒是主要存在于細胞質(zhì)中。RNA和DNA的成分很相似,只有兩點不同,它有核糖而沒有脫氧核糖,有尿嘧啶(U)而沒有胸腺嘧啶(T)。早在1952年,在提出DNA雙螺旋模型之前,沃森就已設(shè)想遺傳信息的傳遞途徑是由DNA傳到RNA,再由RNA傳到蛋白質(zhì)。在1953~1954年間,沃森進一步思考了這個問題。他認為在基因表達時,DNA從細胞核轉(zhuǎn)移到了細胞質(zhì),其脫氧核糖轉(zhuǎn)變成核糖,變成了雙鏈RNA,然后再以堿基對之間的窟窿為模板合成蛋白質(zhì)。這個過于離奇的設(shè)想在提交發(fā)表之前被克里克否決了。克里克指出,DNA和RNA本身都不可能直接充當連接氨基酸的模板。遺傳信息僅僅體現(xiàn)在DNA的堿基序列上,還需要一種連接物將堿基序列和氨基酸連接起來。這個“連接物假說”,很快就被實驗證實了。
1958年,克里克提出了兩個學(xué)說,奠定了 分子遺傳學(xué)的理論基礎(chǔ)。第一個學(xué)說是“序列假說”,它認為一段核酸的特殊性完全由它的堿基序列所決定,堿基序列編碼一個特定蛋白質(zhì)的氨基酸序列,蛋白質(zhì)的氨基酸序列決定了蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。第二個學(xué)說是“ 中心法則”,遺傳信息只能從核酸傳遞給核酸,或核酸傳遞給蛋白質(zhì),而不能從蛋白質(zhì)傳遞給蛋白質(zhì),或從蛋白質(zhì)傳回核酸。沃森后來把中心法則更明確地表示為遺傳信息只能從DNA傳到RNA,再由RNA傳到蛋白質(zhì),以致在1970年發(fā)現(xiàn)了病毒中存在由RNA合成DNA的反轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象后,人們都說中心法則需要修正,要加一條遺傳信息也能從RNA傳到DNA.事實上,根據(jù)克里克原來的說法,中心法則并無修正的必要。
堿基序列是如何編碼氨基酸的呢?克里克在這個破譯這個 遺傳密碼的問題上也做出了重大的貢獻。組成蛋白質(zhì)的氨基酸有20種,而堿基只有4種,顯然,不可能由1個堿基編碼1個氨基酸。如果由2個堿基編碼1個氨基酸,只有16種(4的2次方)組合,也還不夠。因此,至少由3個堿基編碼1個氨基酸,共有64種組合,才能滿足需要。1961年,克里克等人在噬菌體T4中用遺傳學(xué)方法證明了蛋白質(zhì)中1個氨基酸的順序是由3個堿基編碼的(稱為1個密碼子)。同一年,兩位美國分子遺傳學(xué)家馬歇爾·尼倫伯格(Marshall Nirenberg)和約翰·馬特哈伊(John Matthaei)破解了第一個密碼子。到1966年,全部64個密碼子(包括3個合成終止信號)被鑒定出來。作為所有生物來自同一個祖先的證據(jù)之一,密碼子在所有生物中都是基本相同的。人類從此有了一張破解遺傳奧秘的密碼表。
DNA雙螺旋模型(包括中心法則)的發(fā)現(xiàn),是20世紀最為重大的科學(xué)發(fā)現(xiàn)之一,也是生物學(xué)歷史上惟一可與 達爾文進化論相比的最重大的發(fā)現(xiàn),它與自然選擇一起,統(tǒng)一了生物學(xué)的大概念,標志著分子遺傳學(xué)的誕生。這門綜合了遺傳學(xué)、生物化學(xué)、 生物物理和信息學(xué),主宰了生物學(xué)所有學(xué)科研究的新生學(xué)科的誕生,是許多人共同奮斗的結(jié)果,而克里克、威爾金斯、弗蘭克林和沃森,特別是克里克,就是其中最為杰出的英雄。
沃森的人生歷程
沃森出生于 美國芝加哥。孩提時代就非常聰明好學(xué),他有一個口頭禪就是“為什么?”,往往簡單的回答還不能滿足他的要求。他通過閱讀《世界年鑒》記住了大量的知識,因此在參加的一次廣播節(jié)目比賽中獲得“天才兒童”的稱號,而贏得100美元的獎勵。他用這些錢買了一個雙筒望遠鏡,專門用它來觀察鳥。這也是他和爸爸的共同愛好。
由于有異常天賦,沃森15歲時就進入芝加哥大學(xué)就讀。在大學(xué)的學(xué)習中,凡是他喜歡的課程就學(xué)得好,例如《生物學(xué)》,《動物學(xué)》成績特別突出。而不喜歡的課程就不怎么樣了。他曾打算以后能讀研究生,專門學(xué)習如何成為一名“自然歷史博物館”中鳥類館的館長。
在大學(xué)高年級時,沃森閱讀了一本艾爾文·薛定諤的書《生命是什么?》。他深深地被控制生命的奧秘的基因和染色體吸引住了。當S·盧里亞(一位從事噬菌體研究的先驅(qū)者)成為他的 博士生導(dǎo)師時,沃森就有了很好的機會來從事這方面的研究了。
1950年完成博士學(xué)業(yè)后,沃森來到了 歐洲。先是在丹麥的 哥本哈根工作,后來就加入著名的英國劍橋大學(xué)的卡文迪什實驗室工作。從那時起,沃森知道DNA是揭開生物奧秘的關(guān)鍵。他下決心一定要解決DNA的結(jié)構(gòu)問題。他很幸運能和 弗朗西斯·克里克共事。盡管彼此的工作內(nèi)容不同,但兩人對DNA的結(jié)構(gòu)都非常感興趣。當他們終于在1953年建構(gòu)出第一個DNA的精確模型時,完成了被認為是至今為止科學(xué)上最偉大的發(fā)現(xiàn)之一。
1962年,沃森與克里克,偕同威爾金斯共享 諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎。 莫里斯·威爾金斯和羅莎琳德·富蘭克林提供了有關(guān)DNA結(jié)構(gòu)的必要數(shù)據(jù)。沃森為此專門寫了一本書《雙螺旋-發(fā)現(xiàn)DNA結(jié)構(gòu)的故事》,于1968年發(fā)表。這本書是首次采用談話的形式描述進行科學(xué)發(fā)現(xiàn)的詳細過程,一直暢銷不衰。
1956沃森到哈佛大學(xué)任生物學(xué)的助理教授。在那里他的研究重點是RNA和RNA在基因信息傳遞中所起的作用。1976年沃森擔任美國冷泉港實驗室主任。沃森使冷泉港實驗室成為世界上最好的實驗室之一,該實驗室主要從事腫瘤、神經(jīng)生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的研究。
沃森在生物科學(xué)的發(fā)展中起了非常大的作用,例如在攻克癌癥研究上,在 重組DNA技術(shù)的應(yīng)用上等等。他還是 人類基因組計劃的倡導(dǎo)者,1988年至1993年曾擔任人類基因組計劃的 主持人。
沃森另一個感興趣的問題就是教育,他的第一本教科書《基因的分子生物學(xué)》為生物學(xué)課本提供了新的標準。隨后陸續(xù)出版了《細胞分子生物學(xué)》、《重組DNA》。他還積極探索利用多媒體進行教育的方法,并且通過互聯(lián)網(wǎng)設(shè)立DNA學(xué)習中心,這一中心也成為冷泉港實驗室的教育助手。
沃森被許多人描述為:才華橫溢、直言不諱、性格怪異。他知識淵博而不迂腐。精力非常旺盛,從學(xué)生時代開始他就很喜歡打網(wǎng)球。每天都堅持打一會兒網(wǎng)球。