萬(wàn)書元教授主要從事建筑美學(xué)、藝術(shù)美學(xué)的研究，主要著作有《藝術(shù)美學(xué)》、《當(dāng)代西方建筑美學(xué)》、《藝術(shù)的文化闡釋》、《美術(shù)鑒賞》（合著）、《老書院》、《第十位繆斯：中國(guó)現(xiàn)代諷刺小說(shuō)論（1917-1949）》、《神話探幽》、《幽默與諷刺藝術(shù)》、《諷刺論》（譯著）等，其中《藝術(shù)美學(xué)》被列入普通高等教育“十五”國(guó)家級(jí)重點(diǎn)教材；發(fā)表論文近百篇。

萬(wàn)書元教授曾獲江蘇省哲學(xué)社會(huì)科學(xué)優(yōu)秀成果一等獎(jiǎng)（合作）、三等獎(jiǎng)，江蘇省高等教育教學(xué)成果特等獎(jiǎng)（合作），國(guó)家優(yōu)秀教材二等獎(jiǎng)（合作），中國(guó)高校人文社會(huì)科學(xué)優(yōu)秀成果三等獎(jiǎng)。