1917年，王漱芳考入貴州模范中學(xué)（即清朝末年創(chuàng)辦的貴州第一中學(xué)堂）。1919年畢業(yè)時(shí)，被貴州省官費(fèi)保送入武昌商科大學(xué)，后轉(zhuǎn)蘇州國(guó)立東南大學(xué)。當(dāng)時(shí)，華東地區(qū)受孫傳芳控制，中國(guó)國(guó)民黨則在地下活動(dòng)。王漱芳在國(guó)立東南大學(xué)加入中國(guó)國(guó)民黨，宣傳孫中山的政見(jiàn)，組織學(xué)生開(kāi)展反軍閥的活動(dòng)。

1925年，為籌備北伐，遵照中國(guó)國(guó)民黨中央的指示，王漱芳和東南大學(xué)及華東地區(qū)其他高校的地下中國(guó)國(guó)民黨黨員從上海乘船赴廣東。王漱芳被安排到國(guó)民革命軍第一軍司令部任機(jī)要秘書(shū)，當(dāng)時(shí)第一軍軍長(zhǎng)何應(yīng)欽也是貴州人，王漱芳的哥哥王慶芳是何應(yīng)欽的老同學(xué)，再加上王漱芳到任后辦事才能突出，故王漱芳受到何應(yīng)欽及第一軍其他領(lǐng)導(dǎo)的賞識(shí)。

第一軍被編為北伐東路軍后，王漱芳升任東路軍的第一軍總指揮部秘書(shū)長(zhǎng)。1927年，東路軍勝利開(kāi)入浙江，王漱芳兼任中國(guó)國(guó)民黨浙江省黨部黨務(wù)指導(dǎo)委員、常務(wù)委員。南京國(guó)民政府成立后，王漱芳任國(guó)民政府訓(xùn)練總監(jiān)部秘書(shū)主任，隨后又出任國(guó)民政府交通部秘書(shū)廳主任和國(guó)民革命軍總司令行營(yíng)參議。1928年起，王漱芳?xì)v任中國(guó)國(guó)民黨南京特別市黨部監(jiān)察委員、國(guó)民會(huì)議總選舉事務(wù)所參事、國(guó)民會(huì)議代表，中國(guó)國(guó)民黨第三次、第四次全國(guó)代表大會(huì)代表。1931年至1935年，王漱芳連任兩屆南京市政府秘書(shū)長(zhǎng)。與此同時(shí)，他還兼任立法院立法委員、監(jiān)察院參事。1931年，在中國(guó)國(guó)民黨第四次全國(guó)代表大會(huì)南京會(huì)議上，王漱芳被提名為中央執(zhí)行委員候選人，但因不滿30歲，未達(dá)到中央執(zhí)行委員的年齡要求而未能入選。1935年，在中國(guó)國(guó)民黨第五次全國(guó)代表大會(huì)上，王漱芳當(dāng)選為中央執(zhí)行委員，一直任至逝世。

1937年至1938年，王漱芳被派赴貴州任中國(guó)國(guó)民黨貴州省黨部主任委員。1938年調(diào)至重慶，任中國(guó)國(guó)民黨中央軍事委員會(huì)戰(zhàn)地黨務(wù)服務(wù)組中將組長(zhǎng)。此時(shí)，在陪都重慶成立中華全國(guó)中蘇文化協(xié)會(huì)，作為協(xié)調(diào)中華民國(guó)與蘇聯(lián)之間的友好活動(dòng)的群眾團(tuán)體，王漱芳被任命為首屆會(huì)長(zhǎng)。

1940年，王漱芳奉派隨谷正倫赴甘肅省，谷正倫任甘肅省主席，王漱芳任甘肅省政府秘書(shū)長(zhǎng)兼甘肅省民政廳廳長(zhǎng)，還兼中央銀行甘肅省分行董事長(zhǎng)。谷正倫出身軍人，一直任軍職，且常赴重慶開(kāi)會(huì)，故王漱芳負(fù)責(zé)甘肅省的日常行政事務(wù)。

1942年，王漱芳根據(jù)中國(guó)國(guó)民黨的方針政策及甘肅省的情況，撰寫(xiě)了《甘肅省施政綱領(lǐng)與中心工作》，經(jīng)谷正倫及甘肅省政府有關(guān)會(huì)議審定之后，召集甘肅省屬各部門(mén)召開(kāi)大會(huì)，由王漱芳據(jù)此報(bào)告。后來(lái)印刷成書(shū)，在甘肅省發(fā)行。

1943年，王漱芳出巡縣政，在隴南岷縣的一個(gè)懸崖邊，因馬后腳騰起，從馬背上跌落懸崖，當(dāng)場(chǎng)身亡。