遺址堆積層厚1―3米，文化層計有五大層，疊壓清楚，除表土外，第二層主要是距今300年前明代晚期的遺存，中間發(fā)現(xiàn)有春秋時期的堆積及東漢晚期的兩座墓葬。第一期發(fā)掘的屬先民的垃圾堆，主要是吃用后的遺棄物。第二期發(fā)掘的屬先民的居住區(qū)，在一千平方米的揭露面積就清理出近三百平方米的居住面，從住屋的地板及有規(guī)則的柱洞等遺跡看來，當時是用樹干支撐的草棚。象這樣大范圍居住面的發(fā)現(xiàn)，在廣東省境內(nèi)為首次。

出土遺物十分豐富，陶片數(shù)量之多為全省之冠，石器、骨器、角器多達一千多件。在青銅時代早期文化層中的石器有斧、有肩有段石錛、梯形錛、鑿、錐、戈、矛、鏃、環(huán)、璜、戚，還有加工石器用的礪石和捕魚用的豬腰形網(wǎng)墜等；陶器有釜、盤、豆、罐、環(huán)紡輪等；用牛、鹿等動物的骨和角制造的箭頭、錐、鏢、環(huán)、珠、笄等。陶器紋飾有方格紋、曲析紋、葉脈紋、雙線方格紋、雙線雙格凸點紋、梯子格紋、弦紋、繩紋、云雷紋等十多種。另外，在明代，村落遺址中出土了銅鏡、青花碗、墨硯、珠飾等珍貴文物。

村頭村遺址的發(fā)現(xiàn)與清理，對確立珠江三角洲地區(qū)的早期青銅文化有著極為重要的意義。在種類繁多的出土遺物中，陶器以其形制、花紋、陶色構(gòu)成了珠江三角洲地區(qū)這一時期考古學文化陶器群的典型特點，為今后國內(nèi)外考古學家研究珠江三角洲地區(qū)古代文化，提供了不可缺少的實物資料。

1989年6月29日，村頭村遺址被列為廣東省文物保護單位。

1987年冬天　廣深高速公路修建，發(fā)現(xiàn)村頭遺址；

1989年6月29日　村頭遺址被列為廣東省文物保護單位；

1989年8月　對村頭遺址進行第一期挖掘；

1990年5月　遺址第一次挖掘結(jié)束；

1993年3月-7月　對村頭遺址進行第二期發(fā)掘；

2006年-2008年　東莞市博物館有關(guān)專家對出土文物進行復原；

2008年　在村頭遺址上面修建休閑公園；

2009年　東莞市博物館將出版《東莞村頭》一書。

從挖掘的土層看，村頭遺址古人生活區(qū)域分工更清晰，已經(jīng)有居住區(qū)、飼養(yǎng)區(qū)等。他們的食物以貝類動物為主，并狩獵一些像鹿之類的動物，最大的突破就是出土的豬、狗遺骸，說明3000多年前，村頭先民已經(jīng)養(yǎng)豬。

嶺南地區(qū)最早的家養(yǎng)豬

北京大學考古文博學院考古專家聯(lián)合東莞市博物館村頭遺址研究課題工作小組 ，在2006年，對在1989年和1993年挖掘出來的4000多件動物骨骼標本做了科學的分析，研究發(fā)現(xiàn)村頭遺址的豬可能是家養(yǎng)動物，并為嶺南地區(qū)最早的家畜。

貝類動物為主食

考古學家認為，珠三角古人采食以貝類動物為主，加以部分豬、牛為輔。這與其生存環(huán)境有關(guān)。以前只能是靠山吃山、靠水喝水，當時珠三角屬濱海地區(qū)，人們在靠近水的地方采集食物。而據(jù)專家考證，貝丘遺址先民們的食物來源相當多樣，其中鹿、魚、貝類是狩獵和漁撈所獲。

房屋風格為圓形和近方形

村頭貝丘遺址清理出近300平方米的居住面上，從住屋的地板及有規(guī)則的柱洞等遺跡看來，當時是用樹干作為支撐，頂蓋上覆蓋植物莖葉和草拌泥之類，以防日曬和雨水，最后形成外觀圓形和近方形的房屋。

火烤痕跡探究

村頭遺址古人發(fā)現(xiàn)了其居住地面有火烤的痕跡，根據(jù)專家推測，有兩種可能。一是因為煮飯時燒火留下的炭灰；二是古人有用木炭將地面燒干，然后在上面居住的做法，這樣可以使地面硬化，加固居住平面的硬度。

遺址山坡前迎坦田，古為海域。在挖出的遺存中，大部分堆積含有貝殼。遺址靠近海濱和河湖岸邊的古遺址，因其堆積物中包含大量的貝類介殼，在考古學上被稱為“貝丘”遺址。