1978年，考入復(fù)旦大學(xué)生物系。

2001年，當(dāng)選院士時只有39歲，打破院士40歲的“天花板”，名噪一時。

2002年，他獲得少將軍銜時，也只有40歲。同年，人類蛋白質(zhì)組研究組織（Human Proteome Organization）啟動。幾番激烈爭奪之后，最終由賀福初擔(dān)任人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃（HLPP）負(fù)責(zé)人，他也是中國領(lǐng)導(dǎo)此類大型國際研究計劃的第一人。

2003年SARS爆發(fā)，軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院第一個分離出了SARS的冠狀病毒，很快就建立了診斷方法，并研制了治療藥物及防護(hù)設(shè)備。賀福初在抗擊SARS的研究中頗有建樹。

2012年11月，賀福初12名院士當(dāng)選為十八大中央候補(bǔ)委員。

2016年4月，以中央軍委科技委員會副主任的新職務(wù)亮相。

2017年9月，任軍科院副院長。

中共第十八屆代表大會代表、十八屆中央候補(bǔ)委員；

國際人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃共同執(zhí)行主席；

國際人類蛋白質(zhì)組組織理事；

亞太地區(qū)人類蛋白質(zhì)組組織副主席；

中華醫(yī)學(xué)會副會長；

中國遺傳學(xué)會副理事長；

中國生物物理學(xué)會副理事長；

北京市科協(xié)副主席；

中國人類蛋白質(zhì)組組織主席；

國務(wù)院學(xué)位評定委員會學(xué)科評審組成員；

國家“863”計劃生物與醫(yī)藥技術(shù)領(lǐng)域?qū)＜医M成員；

國家中長期“蛋白質(zhì)科學(xué)重大研究計劃”專家組副組長；

中國博士后基金會理事；

全軍醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)委員會副主任委員；

全軍防生物危害專業(yè)委員會主任委員；

總裝科技委兼職委員及軍用生物技術(shù)專業(yè)論證組組長；

軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院院長；

北京蛋白質(zhì)組研究中心理事長；

蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點實驗室主任；

Proteomics、Proteomics-Clinical Application資深編輯；

Journal of Proteomics & Bioinformatics執(zhí)行編輯；

Journal of Proteome Research編委；

主要從事基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)及系統(tǒng)生物學(xué)研究。少將，研究員，專業(yè)技術(shù)一級，博士生導(dǎo)師。

歷任軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實習(xí)研究員、助理研究員、副研究員、研究員、副所長、所長，副院長，院長，中國人民解放軍疾病預(yù)防控制中心主任，北京蛋白質(zhì)組研究中心首任主任。

2017年9月，賀福初任軍科院副院長。

Zhang H, et al. Genome-wide association study identifies 1p36. 22 as a new susceptibility locus for hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis B virus carriers.Nat Genet.2010, 42, 755-8.

Tian C, et al. “KRAB-type zinc-finger protein Apak specifically regulates p53-dependent apoptosis”,Nature Cell Biol.2009,11, 580-91.

Tang L, et al. Liver Sinusoidal Endothelial Cell Lectin, LSECtin, Negatively Regulates Hepatic T-Cell Immune Response. Gastroenterology.2009,137(4):1498-508.

Lu K, et al. “Targeting WW domains linker of HECT-type ubiquitin ligase Smurf1 for activation by CKIP-1”,Nature Cell Biol.2008,10, 994-1002.

Deng G, et al. “Regulatory Polymorphisms in the Promoter of CXCL10 Gene and Disease Progression in Male Hepatitis B Virus Carriers”,Gastroenterology.2008,134, 716-26.

Zhi L, et al. “Lack of support for an association between CLEC4M homozygosity and protection against SARS coronavirus infection”,Nature Genetics.2007,39(6):692-4.

Li L, et al. “PACT is a negative regulator of p53 and essential for cell growth and embryonic development”,Proc. Natl. Acad. Sci. USA.2007,104:7951-6.

Miao X, et al. “Estrogen Receptor alpha Polymorphisms Associated with Susceptibility to Hepatocellular Carcinoma in Hepatitis B Virus Carriers”,Gastroenterology.2006,130(7):2001-9.

Zhai Y, et al. ADPRT 762Ala Polymorphisms Is Associated with Reduced Interaction of ADPRT and XRCC1 and Increased Risk of Gastric Cardia Cancer.Gastroenterology.2006,131:420-7

Zhang L, et al. “Role for the pleckstrin homology domain-containing protein CKIP-1 in AP-1 regulation and apoptosis”,EMBO J.2005,24, 766-78.

Deng G, et al. “Association of estrogen receptor alpha polymorphisms with susceptibility to chronic hepatitis B virus infection”,Hepatology.2004,40, 318-26.

Yu Y, et al. “Gene Expression Profiling in Human Fetal Liver and Identification of Tissue- and Developmental-Stage-Specific Genes through Compiled Expression Profiles and Efficient Cloning of Full-Length cDNAs”,Genome Res.2001. 11, 1392-403

主編《生物信息學(xué)——方法與實踐》、《造血調(diào)控》、《蛋白質(zhì)組學(xué)的理論與技術(shù)》、《嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征（sars）》等

參編《生命的歲月與夢幻》、《基因組科學(xué)與人類疾病》、《蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)》、《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》。

主要研究領(lǐng)域為細(xì)胞因子的分子生物學(xué)及基因工程。發(fā)現(xiàn)一種能特異刺激肝細(xì)胞增殖和肝臟再生的新細(xì)胞因子即人肝細(xì)胞生成素(HPO)，在國際上首次公布其cDNA序列，并率先研制出重組人HPO首次揭示了存在于原代肝細(xì)胞或肝癌細(xì)胞膜上的HPO高親和力特異性受體及HPO兩條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。開展規(guī)�；�的人胎肝cDNA克隆與測序，建立了大規(guī)模、系統(tǒng)的基因表達(dá)譜，發(fā)現(xiàn)與肝臟發(fā)育、分化、癌變以及造血系統(tǒng)發(fā)育等相關(guān)的基因群。提出生長因子的“發(fā)育相關(guān)進(jìn)化”、細(xì)胞活性因子與受體的“協(xié)同進(jìn)化”、mRNA編碼區(qū)與非編碼區(qū)的“協(xié)調(diào)進(jìn)化”、種系發(fā)生中的“分子減速進(jìn)化”等規(guī)律性認(rèn)識，并進(jìn)行了部分實驗驗證。[2] 

1 發(fā)現(xiàn)“細(xì)胞活性因子的發(fā)育相關(guān)進(jìn)化”、“相互作用分子的協(xié)同進(jìn)化”、“mRNA編碼區(qū)與非編碼區(qū)的協(xié)調(diào)進(jìn)化”及“物種演化中的分子減速進(jìn)化”等規(guī)律性現(xiàn)象；

2 發(fā)現(xiàn)并克隆肝細(xì)胞生成素、揭示其基因調(diào)控機(jī)制、研制其重組品，發(fā)現(xiàn)其受體及其兩條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路；

3 揭示人胎肝、成體肝轉(zhuǎn)錄組及其蛋白質(zhì)組，從中發(fā)現(xiàn)500余種新基因、新蛋白質(zhì)；

4 發(fā)現(xiàn)中國常見惡性腫瘤及慢性肝炎等的易感基因10余種; 倡導(dǎo)并領(lǐng)銜了人類第一個組織、器官的“肝臟蛋白質(zhì)組計劃”，這也是中國第一次領(lǐng)導(dǎo)大型國際合作計劃，Nature、Science、Nature Biotechnology等國際著名雜志給予首肯；

5 2001年當(dāng)選為中國科學(xué)院院士；2005年當(dāng)選發(fā)展中國家科學(xué)院院士；

2005、2006年獲國家自然科學(xué)二等獎；

1999、2000年獲國家科技進(jìn)步二等獎；

1997、2005年獲軍隊科技進(jìn)步一等獎；

2002、2003、2005年獲北京市科學(xué)技術(shù)獎一等獎；

1993年被評為“全國中青年醫(yī)學(xué)科技之星”、“中國青年科技獎”；

1994年被評為“全國青年科技標(biāo)兵”；

1996年榮獲“國家杰出青年科學(xué)基金”；

1998年榮獲“全國求是杰出青年實用工程獎”、被評為總后勤部“科技金星”；

1999年被批準(zhǔn)為“國家有突出貢獻(xiàn)的中青年專家”；

2002年被評為“中國青年科學(xué)家”、被授予中國“五四”青年獎?wù)拢?/p>

2003年獲“何梁何利基金科學(xué)與技術(shù)進(jìn)步獎”、被評為“全軍優(yōu)秀研究生指導(dǎo)教師”；

2004年被國際人類蛋白質(zhì)組組織授予“研究貢獻(xiàn)獎”；

2005年獲得“軍隊專業(yè)技術(shù)重大貢獻(xiàn)獎”；

2006年所領(lǐng)導(dǎo)（任實驗室主任）的全軍蛋白質(zhì)組學(xué)與基因組學(xué)重點實驗室，獲“軍隊科技創(chuàng)新群體獎”；

2009年被國際蛋白質(zhì)組論壇授予“杰出成就獎”；

2011年被國際人類蛋白質(zhì)組組織授予“杰出服務(wù)獎”；

獲中國發(fā)明專利7項、國家新藥證書1項、美國發(fā)明專利1項。

主編/主譯專著十余部。在Science, Nature Genetics, Nature Cell Biology, Nature Biotechnology, Nature Methods, Nature Protocols, PNAS等國際核心刊物發(fā)表論文200余篇。