生于瓦哈卡州的扎波特克族（Zapotec）純血統(tǒng)的印第安人農(nóng)民家庭。3歲失去父母，由舅父撫養(yǎng)。早年當(dāng)過仆役、學(xué)徒，后進(jìn)天主教神學(xué)學(xué)校學(xué)習(xí)。1829年考入瓦哈卡科學(xué)和藝術(shù)學(xué)院，專攻法律和政治。在歐美自由民主思想的熏陶下，成為當(dāng)時先進(jìn)的知識分子。畢業(yè)后于1834年獲準(zhǔn)開業(yè)當(dāng)律師。

　　1810～1821年墨西哥人民推翻西班牙殖民統(tǒng)治的民族解放戰(zhàn)爭，獨(dú)立以后愛國進(jìn)步力量為建立共和民主制度與捍衛(wèi)民族獨(dú)立的斗爭，都給他以重大影響，激發(fā)了他為捍衛(wèi)民族獨(dú)立、國家主權(quán)和人民自由而戰(zhàn)斗的意志和決心。在1846～1848年抗擊美國武力兼并的衛(wèi)國戰(zhàn)爭中，他堅定不移地站在以自由派為首的愛國力量一邊。1847～1852年，任瓦哈卡州州長，在該州進(jìn)行抗擊美國侵略的準(zhǔn)備，保護(hù)印第安人利益，進(jìn)行行政管理改革，成了杰出的自由派人物。卸任后，他重操律師舊業(yè)，到母�？茖W(xué)和藝術(shù)學(xué)院任教，但不久，他又投入了反對獨(dú)裁、爭取自由的改革斗爭。1854年，胡亞雷斯支持自由派印第安人將軍胡安·阿爾瓦雷斯的“阿尤特拉計劃”，參與推翻安東尼奧·洛佩斯·德·桑塔·安納獨(dú)裁政權(quán)的起義。1855年，在阿爾瓦雷斯政府中任司法部長和首席法官，先后制定了廢除教會與軍官特權(quán)的《華雷斯法》和《萊多法》，并參與領(lǐng)導(dǎo)制訂1857年憲法。1857年底，保守派蘇洛阿加反對改革，發(fā)動叛亂。

　　1858年2月，總統(tǒng)伊格納西奧·科蒙福特逃亡美國，胡亞雷斯出任臨時總統(tǒng)，在瓜納華托組成新的聯(lián)邦政府，領(lǐng)導(dǎo)“革新戰(zhàn)爭”(1858～1860)。1860年12月，胡亞雷斯政府軍打敗了保守派的軍隊。次年 1月，重返首都墨西哥城。1861年 6月，國會正式選舉他為總統(tǒng)。由于財政困難，胡亞雷斯政府于 7月17日宣布停止償付外債兩年。西班牙和英、法債權(quán)國以此為借口，決定共同出兵墨西哥，進(jìn)行早已策劃的干涉。1862年4月，經(jīng)過談判后，英、西撤走了軍隊，但法皇拿破侖三世卻組織遠(yuǎn)征軍擴(kuò)大干涉戰(zhàn)爭。1863年6月，法軍占領(lǐng)墨西哥城，扶植奧地利馬克西米利安大公為墨西哥傀儡皇帝馬西米連諾一世，妄圖把墨西哥變成法國的附庸。

　　1863年 5月，胡亞雷斯撤出首都，向北轉(zhuǎn)移，以邊境城鎮(zhèn)諾爾德(1888年改稱胡亞雷斯城)為根據(jù)地，廣泛開展游擊戰(zhàn)，困擾侵略軍。經(jīng)過3年多的抗戰(zhàn)，到1867年初，戰(zhàn)局朝著有利于墨西哥的方向迅速發(fā)展。法國被迫撤走侵略軍隊。胡亞雷斯乘勢大舉反攻，俘虜傀儡皇帝，光復(fù)全部國土。7月15日，胡亞雷斯政府遷回首都，抗法自衛(wèi)戰(zhàn)爭勝利結(jié)束。1867年和 1871年，胡亞雷斯連續(xù)當(dāng)選為總統(tǒng)。他在任內(nèi)大力進(jìn)行戰(zhàn)后恢復(fù)工作，修筑鐵路，興辦教育，在每個村莊設(shè)立印第安人初級學(xué)校。鎮(zhèn)壓退伍軍人暴動和波費(fèi)里奧·迪亞斯的叛亂。1872年 7月 28日病逝，終年66歲，遺體葬于圣斐南多神廟中。
　　華雷斯一生為捍衛(wèi)墨西哥民族的獨(dú)立、打擊國內(nèi)封建勢力立下了不朽功勛，成為墨西哥國家統(tǒng)一、政治民主和社會進(jìn)步事業(yè)的奠基人之一。墨西哥人民至今一直崇敬他，尊他為最偉大的民族英雄和維護(hù)人民權(quán)利的斗士。一些世界名人也稱他為“   使自由復(fù)活的美洲英雄”。