70年代末，在唐長孺教授領導下，將科研重點轉(zhuǎn)向敦煌吐魯番文書與魏晉南北朝隋唐五代史相結合的研究方面。1975－85年在北京參加國家文物局"吐魯番文書整理小組"的工作，參與編纂出版了《吐魯番出土文書》錄文本1－10冊（主編唐長孺）。獲全國首屆古籍整理圖書一等獎；1999年獲國家哲學社會科學基金項目優(yōu)秀成果一等獎。

1983年參與編寫出版《敦煌吐魯番文書初探》（主編唐長孺）；1990年又參與編纂出版《敦煌吐魯番文書初探二編》（主編唐長孺）。二書1992年獲國家教委會高校出版社優(yōu)秀學術專著特等獎；1995年獲國家教委全國高校人文社會科學研究優(yōu)秀成果一等獎。

80年代以來，參加了《中國大百科全書．歷史卷》詞條撰寫。同時參加了中國敦煌吐魯番學會組織的《敦煌學大辭典》編纂，為史地編委，撰寫了320余條（上海辭書出版社，1998）。

1987－91年承擔、主持了國家教委博士點專項科研基金項目"敦煌吐魯番學中的史地研究。"完成史地研究論文13篇，出版了《斯坦因所獲吐魯番文書研究》（1994年武漢大學學術叢書），1995年獲國家教委第二屆高校出版社優(yōu)秀學術專著一等獎；1998年獲國家教委第二屆全國高校人文社會科學研究優(yōu)秀成果二等獎。1995年4月主編出版了《民族融合締造中華－中華民族的形成與發(fā)展》（武漢大學出版社）。1997年5月與香港中文大學劉建明合作主編出版了《（全唐文）職官叢考》（武漢大學出版社）。10月編撰出版《日本寧彩美術館藏吐魯番文書》（圖文對照本﹒文物出版社），2001年10月獲湖北省人文社會科學研究優(yōu)秀成果三等獎。

80年代以來，利用新出土的地下文獻與傳統(tǒng)史籍相結合、研究中國古代歷史上的新問題，發(fā)表了專題學術論文90篇。并將研究成果實時融匯于教學中，先后多次開設"中國古代史"、 "魏晉南北朝隋唐五代史"、"唐代經(jīng)濟史"、"敦煌吐魯番概論"、"隋唐史專題"、"吐魯番文書研究"等課程。培養(yǎng)了多批碩士、博士。1995年被武漢大學評為"優(yōu)秀研究生指導教師"。80年代以來，先后還在北京大學、廈門大學、蘭州大學、內(nèi)蒙古大學、華中師范大學及香港中文大學、日本東京大學、京都大學、美國耶魯大學做過學術講座、交流或講演，經(jīng)常參與專業(yè)性的國際學術交流和會議。

主編《〈全唐文〉職官叢考》《吐魯番文書總目·日本收藏卷》《吐魯番柏孜克里克石窟出土漢文佛教典籍》，參與編纂《吐魯番出土文書》《敦煌吐魯番文書初探》《中國大百科全書·歷史卷》《敦煌學大辭典》等工作外，還撰著出版了《斯坦因所獲吐魯番文書研究》《日本寧樂美術館藏吐魯番文書》《唐代的經(jīng)濟社會》《敦煌學史事新證》《吐魯番出土唐代文獻編年》《論吐魯番學》《陳國燦吐魯番敦煌出土文獻史事論集》等學術專著，在《歷史研究》《中國史研究》等中外學術刊物上發(fā)表論文百余篇。

相關成果先后獲得首屆國家社科基金項目優(yōu)秀成果獎一等獎、國家教委首屆全國高等學校人文社會科學研究優(yōu)秀成果獎一等獎、教育部普通高等學校第二屆人文社會科學研究成果獎二等獎、教育部第六屆高等學校科學研究優(yōu)秀成果獎（人文社會科學）三等獎，在中外學界產(chǎn)生了重要而深刻的影響，為推動我國敦煌吐魯番學的發(fā)展，尤其是吐魯番學的創(chuàng)建與繁榮做出了卓越的貢獻！

《談吐魯番學研究》

先后多次開設“中國古代史”、 “魏晉南北朝隋唐五代史”、“唐代經(jīng)濟史”、“敦煌吐魯番文書概論”、“隋唐史專題”、“吐魯番文書研究”等課程，長期堅守在教學第一線，培養(yǎng)了一大批本科生和多批碩士、博士生，1995年被評為武漢大學“優(yōu)秀研究生指導教師”。他注重科研與教學有機結合，授課深入淺出，循循善誘，極富親和力與感染力，深受歷屆廣大學生好評。

陳教授從“學者為己”—— 學習是成人之道、“敏而好學”—— 學習是一種人生態(tài)度、“學無常師”——學習是不斷探索的過程三方面為學生們闡述了孔子的學習觀。他認為“學者為己”是我們學習的目的和出發(fā)點，“敏而好學”則是發(fā)自內(nèi)心的人生追求，而溫故知新，學思結合，學而習之則是“學無常師”的基本要求。

火焰山下的古代文明與吐魯番學研究

對新世紀吐魯番學發(fā)展的展望

吐魯番歷史上的四個千年

吐魯番文書在解放前的出土及其研究概況

中國吐魯番文書的研究進展與展望

《吐魯番出土文書》簡介

吐魯番出土文書的整理、分類與定名

略論敦煌吐魯番文獻研究中的史學斷代問題

從敦煌吐魯番學看傳統(tǒng)文化的時代價值

敦煌吐魯番文書與魏晉南北朝隋唐史的研究

吐魯番出土漢文文書與唐史研究

略論吐魯番出土文書與中國古代史研究的關系

略論日本大谷文書與吐魯番新出墓葬文書之關聯(lián)

中、英、日、美、德各國所藏吐魯番文書相互之間的關聯(lián)

東訪吐魯番文書紀要

美國普林斯頓所藏幾件吐魯番出土文書跋

遼寧省檔案館藏吐魯番文書考釋

《俄藏敦煌文獻》中吐魯番出土的唐代文書

略論吐魯番出土的敦煌文書

鄯善新發(fā)現(xiàn)的一批唐代文書

吐魯番出土文獻研究的新進展

漫卷簾衣延草色 欲回春氣人書叢

——對唐長孺師研究出土文獻方法的體會