攝政期間，丹麥得到了飛速發(fā)展，當(dāng)時(shí)海洋上的商船，除了掛英國(guó)國(guó)旗的之外，就數(shù)掛丹麥-挪威國(guó)旗的最多。在內(nèi)政方面，他宣布解放農(nóng)奴，外交方面則經(jīng)歷了對(duì)英戰(zhàn)爭(zhēng)等重大事件。1800年，英國(guó)為了對(duì)法國(guó)作戰(zhàn)，企圖使丹麥卷入，禁止丹麥-挪威商船進(jìn)入法國(guó)和法屬領(lǐng)地港口，甚至將丹麥-挪威商船連人帶貨扣押起來(lái)。弗雷德里克（當(dāng)時(shí)為王太子）反應(yīng)強(qiáng)烈，和俄羅斯帝國(guó)、普魯士王國(guó)共同宣布武裝中立。1801年，英國(guó)要求丹麥退出武裝中立同盟，遭到拒絕，英國(guó)派霍雷肖·納爾遜進(jìn)攻丹麥，給予丹麥艦隊(duì)重創(chuàng)。此后權(quán)衡國(guó)際局勢(shì)，弗雷德里克決定如果中立無(wú)法維持下去就和英國(guó)結(jié)盟。但是英國(guó)出于“凡事都要搶先一步”的考慮，于1807年派出龐大的艦隊(duì)來(lái)到丹麥，要求丹麥交出全部海軍。弗雷德里克表示愿意同英國(guó)結(jié)盟，但是英國(guó)仍然堅(jiān)持沒(méi)收丹麥海軍的要求。9月2日，英軍炮轟哥本哈根，繳獲丹麥全部艦隊(duì)。

1808年，丹麥同拿破侖結(jié)盟。此年弗雷德里克正式即位，此前已經(jīng)以王太子身份攝政了24年。丹麥加入了反法聯(lián)盟，1810年，法國(guó)的貝爾納多特元帥成為瑞典王儲(chǔ)，之后瑞典拋棄法國(guó)，加入反法同盟。在反法同盟的支持下，1814年瑞典從丹麥?zhǔn)种袏Z得了挪威。挪威人則希望獨(dú)立，并選舉了弗雷德里克六世的堂弟克里斯蒂安·腓特烈為挪威國(guó)王，但是不久即被瑞典征服。1814年，與瑞典簽訂《基爾條約》，把挪威割讓給瑞典，結(jié)束了丹麥和挪威多個(gè)世紀(jì)的聯(lián)合。失去挪威之后，腓特烈放棄了擔(dān)任執(zhí)政時(shí)的開(kāi)明思想，改行保守的獨(dú)裁統(tǒng)治，審查和鎮(zhèn)壓反對(duì)勢(shì)力。此外，經(jīng)濟(jì)也大受打擊，至1830年代才稍有起色。1834年，他不得不進(jìn)行輕微的民主改革，成立了地區(qū)性的咨詢議會(huì)。1839年，弗雷德里克六世去世，葬在羅斯基勒。他的兒子都早于他去世，故此他的丹麥王位由表弟克里斯蒂安八世繼承。