1976年2月應征入伍，歷任調度員、副主任、主任、副處長、處長；

1995年10月，任新疆民航局副局長（新疆航空公司副總經(jīng)理）、黨委常委；

1979年至1995年，歷任民航烏魯木齊管理局（中國新疆航空公司）調度室見習調度員、調度員、副主任、主任、航行氣象安監(jiān)處副處長、黨委副書記、處長；

1995年09月，任民航烏魯木齊管理局（中國新疆航空公司）黨委常委、副總經(jīng)理、副局長；

1998年08月，任民航烏魯木齊管理局（中國新疆航空公司）黨委書記、副總經(jīng)理、副局長；

2000年11月，任中國南方航空股份有限公司副董事長、總經(jīng)理、黨委副書記；

2002年10月，任中國南方航空集團公司副總經(jīng)理、黨組成員、中國南方航空股份有限公司副董事長、總經(jīng)理、黨委副書記。

2004年08月，任中國民用航空總局副局長、黨委委員。

2008年03月，任中國民用航空局副局長（副部長級）、黨組成員。

2008年03月，任中國民用航空局副局長、黨組成員（副部長級），兼任局直屬機關黨委書記、全國民航工會主席；

2011年10月，任中國航空集團公司總經(jīng)理、黨組副書記、國航股份公司董事長；

2014年01月，任交通運輸部副部長、黨組成員。

2016年02月，任中國南方航空集團公司總經(jīng)理、黨組副書記

2016年12月-2020年11月，任中國南方航空集團公司董事長、黨組書記。

第十二屆全國人大代表，十二屆廣東省委委員，黨的十九大代表，第十三屆全國政協(xié)常委。

2016年12月6日下午，中國南方航空集團公司召開中層以上管理人員大會。受中央組織部領導委托，中央組織部有關干部局負責同志宣布了黨中央、國務院關于中國南方航空集團公司主要領導調整的決定：按照加快建立中國特色現(xiàn)代國有企業(yè)制度的有關精神，中國南方航空集團公司建立董事會。王昌順同志任董事長、黨組書記，免去其總經(jīng)理職務。

2018年1月24日，政協(xié)第十二屆全國委員會常務委員會第二十四次會議通過，王昌順當選中國人民政治協(xié)商會議第十三屆全國委員會委員。

2020年11月11日下午，中國南方航空集團有限公司召開中層以上管理人員大會。中央組織部有關負責人宣布了黨中央關于中國南方航空集團有限公司主要負責人調整的決定：免去王昌順的中國南方航空集團有限公司董事長、黨組書記職務。