1996年獲美國(guó)美中學(xué)術(shù)交流委員會(huì)研究員基金，赴華盛頓大學(xué)人類學(xué)系進(jìn)行為期一年的博士后研究。

1997、1998年兩次受聘于世界銀行，擔(dān)任安寧河流域農(nóng)業(yè)資源綜合開發(fā)大型項(xiàng)目的社會(huì)評(píng)估工作和擬訂少數(shù)民族發(fā)展計(jì)劃。2000～2001哈佛大學(xué)燕京學(xué)社高級(jí)訪問學(xué)者。

2013年11月至2018年05月，任中央民族干部學(xué)院黨委副書記、常務(wù)副院長(zhǎng)（正司級(jí)）。

2018年05月，任中央民族干部學(xué)院黨委書記。

2018年5月7日，中共國(guó)家民委黨組決定：巴莫阿依同志任中央民族干部學(xué)院黨委書記（試用期1年）；免去其中央民族干部學(xué)院常務(wù)副院長(zhǎng)職務(wù)。

堅(jiān)持長(zhǎng)期深入川、滇、黔民族地區(qū)的山村做定點(diǎn)或周期性的田野調(diào)查，以大量的第一手材料為基礎(chǔ)結(jié)合彝文經(jīng)籍進(jìn)行研究，已出版?zhèn)�人專著《彝族祖靈信仰研究》，譯著《田野中的族群關(guān)系和民族認(rèn)同》，合著《彝族文化史》、《彝族風(fēng)俗志》、《中國(guó)少數(shù)民族文化史》；發(fā)表《論彝族畢摩階層的特征》、《試論彝族畢摩的傳承和教育》、《論彝文文獻(xiàn)分類》、《中國(guó)大涼山彝族山民的儀式生活》以及《涼山彝族〈驅(qū)鬼經(jīng)〉彝漢對(duì)照本導(dǎo)論》等論文四十余篇（中、日、英、彝文），譯文十余篇。

曾獲北京市青年的最高榮譽(yù)“五四獎(jiǎng)?wù)隆保�被列為北京市青年學(xué)科帶頭人，聯(lián)合國(guó)第四屆世界婦女大會(huì)論壇代表。這些年來，她還與自己的兩位妹妹組成“巴莫姊妹彝學(xué)小組”，逐步將本民族的文化傳承介紹給了世界。

巴莫阿依選擇的是讓世界了解涼山、了解彝人的道路。阿依說起初對(duì)彝族文化也并不了解，是父親幫助她們選擇了這條道路，她至今還記得父親說過的那句改變她命運(yùn)的那句話：“在把西昌建設(shè)成為物質(zhì)文明、精神文明的同時(shí)，還要把西昌建設(shè)成為具有濃郁民族特色的新型的現(xiàn)代化城市�！� 她在《與美國(guó)木嘎做田野調(diào)查》等一系列田野報(bào)告中就向世界介紹了涼山的今天與未來。

巴莫阿依的父親巴莫爾哈曾經(jīng)做過涼山州的副州長(zhǎng)，他對(duì)涼山州文化事業(yè)的發(fā)展有著自己獨(dú)特的眼光，對(duì)子女的期望也不同于一般家長(zhǎng)。大女兒巴莫阿依和二女兒畢業(yè)以后都分配回涼山州的政府部門工作，按理說，80年代初，彝族女性大學(xué)生還比較少，從政是完全可能的，可巴莫卻對(duì)她們說：我們彝族不缺幾個(gè)處長(zhǎng)局長(zhǎng)，缺的是專家學(xué)者和教授。于是已經(jīng)工作的兩個(gè)女兒又考上了研究生、博士生，去年雙雙在著名的哈佛大學(xué)做訪問學(xué)者。1991年，巴莫又鼓勵(lì)三個(gè)女兒組織起了“巴莫姊妹彝學(xué)小組”。幾年中，三姐妹跋山涉水作了大量彝族民俗調(diào)查，寫出了許多專著。巴莫阿依還是第二屆國(guó)際彝學(xué)會(huì)議的發(fā)起人之一，是第三屆國(guó)際彝學(xué)會(huì)議的執(zhí)行主席。如果說上個(gè)世紀(jì)八九十年代后彝學(xué)研究呈滔滔大河之勢(shì)，那么，巴莫彝學(xué)姊妹小組是其中重要的力量之一。

巴莫阿依說，傳統(tǒng)是條流動(dòng)的河。一個(gè)民族的文化要發(fā)展、壯大，既是一個(gè)積累的過程，同時(shí)又是不斷揚(yáng)棄、吸納的過程。要有開放的心態(tài)擁抱中國(guó)的、世界的先進(jìn)文化，而不是固步自封。因?yàn)橹挥性诒容^的視野中，才能更徹底了解自己。