馬特伊科出生于1838年6月24日的克拉科夫自由市。 他父親弗蘭齊謝克·克薩韋雷·馬特伊科（波蘭語(yǔ)：Franciszek Ksawery Matejko，捷克語(yǔ)：Franti?ek Xaver Matějka）（1789年或1793年1月13日—1860年10月26日）是來(lái)自羅迪采的捷克人，他畢業(yè)于赫拉德茨-克拉洛韋學(xué)校；后來(lái)成為一名家庭教師與音樂(lè)教師。 他起初受科希切爾尼基的沃齊茨基家族雇傭，后來(lái)遷至克拉科夫，在那里他與擁有半日耳曼半波蘭血統(tǒng)的約安娜·卡羅琳娜·羅斯伯格結(jié)婚。 揚(yáng)是家中11個(gè)孩子中的第九子。在1846年母親去世后，揚(yáng)和他的同伴由他的表親安娜·扎莫伊斯卡養(yǎng)育。

自幼年時(shí)起，馬特伊科就展示了其卓越的藝術(shù)天賦，這種天賦使他即便其他科目薄弱，卻還是能夠完成學(xué)業(yè)。他從未掌握過(guò)任何一門外語(yǔ)，甚至也無(wú)法靈活運(yùn)用他的母語(yǔ)波蘭語(yǔ)。因此，樹立公眾形象對(duì)他來(lái)說(shuō)是很困難的事，但他又不得不做。

年輕時(shí)，他曾親身經(jīng)歷1846年的克拉科夫起義，以及1848年奧軍對(duì)克拉科夫的包圍。這兩件事讓克拉科夫自由市從此成為歷史。 他的兩位哥哥進(jìn)入約瑟夫·貝姆帳下，其中一人戰(zhàn)死，另一人被迫流亡。

馬特伊科進(jìn)入圣安高級(jí)中學(xué)，但后因成績(jī)不佳，被開除。盡管如此，因?yàn)樗麅?yōu)異的繪畫才能，他得以在1852年至1858年間于克拉科夫美術(shù)學(xué)院就讀。 他的老師包括沃依切赫·科爾內(nèi)利·斯塔特勒爾和瓦迪斯瓦夫·武什奇凱維奇。這個(gè)時(shí)候，他就在美術(shù)之友學(xué)會(huì)從事歷史畫的繪作（譬如1535年的《帶著崇高的敬意，獻(xiàn)給克拉科夫大學(xué)教授的齊格蒙特一世肖像畫》） 他后來(lái)在慕尼黑于歷史畫家赫爾曼·安許茨門下學(xué)畫，還短暫并慘淡地在維也納呆過(guò)一陣，隨后便回到了克拉科夫。但是，從這個(gè)時(shí)候到馬特伊科獲得商業(yè)上的成功還有一段時(shí)間；他曾當(dāng)過(guò)著名的“挨餓藝術(shù)家”，這個(gè)綽號(hào)來(lái)自于他用一幅油畫（Tsars Szujscy）換得5基爾德錢的經(jīng)歷。

1863年一月起義爆發(fā)，因?yàn)樯眢w原因馬特伊科沒(méi)有參加，但他向戈什恰的起義軍提供財(cái)政支持與軍火。1864年他與泰奧多拉·蓋布爾托夫斯卡結(jié)婚，育有4名子女：比塔、海倫娜、塔德烏什和耶日。同年，他成為克拉科夫科學(xué)學(xué)會(huì)的成員。他的長(zhǎng)子塔德烏什在其父親的管教之下也成為了一名畫家。 而他的女兒海倫娜也成為了一名畫家，她還是一位幫助第一次世界大戰(zhàn)的受害者的愛(ài)國(guó)人士，受到總統(tǒng)斯坦尼斯瓦夫·沃伊切霍夫斯基的表彰。

在那時(shí)馬特伊科開始受到國(guó)際認(rèn)可。1865年，馬特伊科的畫作《斯卡爾加的布道》在一年一度的巴黎博覽會(huì)上獲得金獎(jiǎng)；隨后毛雷奇·波托茨基伯爵開價(jià)10000基爾德將其買下。 1868年，他的畫作《雷伊坦》在巴黎世博會(huì)獲得金獎(jiǎng)。評(píng)論家稱馬特伊科是歐洲最重要的歷史畫家之一。 他成功地從一個(gè)波蘭人的角度，描繪了波蘭的歷史，讓全世界還記得起波蘭，這個(gè)在當(dāng)時(shí)已經(jīng)覆滅，毫無(wú)獨(dú)立政治地位，卻還是讓眾多人牽腸縈心的國(guó)家。

他自1873年起成為美術(shù)學(xué)院的校長(zhǎng)，并擔(dān)任此職多年。

馬特伊科在1893年11月1日辭世。他被葬在克拉科夫拉科維茨基公墓的先賢祠。

1860年，馬特伊科出版一部插畫集《波蘭的服飾》（Ubiory w Polsce），這是一部體現(xiàn)他對(duì)各種各樣的歷史文獻(xiàn)的興趣，以及將這種興趣推廣到波蘭人，以掀起他們的愛(ài)國(guó)熱情的希望的作品。1861年，他在華沙扎亨塔舉辦了一次稱作“博娜女王下毒身亡”（Otrucie królowej Bony）的展覽。國(guó)家的戰(zhàn)敗迫使他放棄基督教宗教繪畫（他曾認(rèn)為這種畫是他的本行），而專心致力于歷史畫的創(chuàng)作。事實(shí)上，他開創(chuàng)了一種新的波蘭歷史觀，這種觀念認(rèn)為無(wú)論科學(xué)家們?cè)趺捶裾J(rèn)，我們還是不能解放我們自己。馬特伊科經(jīng)常將在歷史上并不出現(xiàn)在某一事件的人畫在描繪這件事的畫上（比如在《拉茨瓦維采戰(zhàn)役》中出現(xiàn)胡戈·科萬(wàn)塔伊和約瑟夫·沃齊茨基將軍）。他對(duì)描繪真實(shí)事件不感興趣，但卻樂(lè)于將歷史與哲學(xué)相結(jié)合。馬特伊科的作品被認(rèn)為是不僅有藝術(shù)價(jià)值，也有社會(huì)意義，且不僅在當(dāng)時(shí)具有這樣的現(xiàn)實(shí)意義，在現(xiàn)在也有。他視歷史為依現(xiàn)在和未來(lái)形勢(shì)的變化而變化的事物。馬特伊科的畫作不僅僅描繪歷史，更能表現(xiàn)他的心理和他對(duì)世界的態(tài)度。

馬特伊科關(guān)注波蘭歷史上的重要事件，并查閱歷史文獻(xiàn)，以畫出細(xì)微的歷史細(xì)節(jié)。他的歷史畫可分為兩大部分。第一個(gè)部分以《斯坦奇克》（Stańczyk）（1862年繪）開始，內(nèi)容主要是直接批判那些不愛(ài)國(guó)的權(quán)貴，在他眼中，這些人導(dǎo)致了波蘭的滅亡。斯坦奇克是齊格蒙特一世（1437年-1548年）的弄臣，而在畫中，馬特伊科畫出了他的特征。這位弄臣是國(guó)家良心的象征：他與其他的人物隔離開，憂郁地坐在椅子上，獨(dú)自看著莫斯科戰(zhàn)爭(zhēng)最終以慘敗收?qǐng)觥＿@一類畫作中還包括《皮奧特爾·斯卡爾加的布道》（Kazanie Skargi）（1864年繪）和《雷伊坦》（1866年繪）。

第二組是在一月起義后畫的，是描繪波蘭史上的重要事件。馬特伊科畫了很多關(guān)于波蘭史上重大戰(zhàn)役和事件的畫作。其中最有名的是《格倫瓦德之戰(zhàn)》（Bitwa pod Grunwaldem）（1878年），畫的是1410年波蘭-立陶宛聯(lián)軍對(duì)條頓騎士團(tuán)的全面勝利；這幅畫“明顯”地體現(xiàn)了“愛(ài)國(guó)者的竭盡全力”， 使其在國(guó)際上被稱贊為“波蘭民族主義無(wú)與倫比的象征”。 處在這一組別的畫作還包括《盧布林聯(lián)合》（Unia Lubelska）（1869年繪）、《斯特凡·巴托里圍攻普斯科夫》（1872年繪）、《哥白尼》（Kopernik）、《齊格蒙特之鐘》（Dzwon Zygmunta）（1874年繪）、《普魯士稱臣》（Ho?d Pruski）（1882年繪）、《約翰三世在維也納之戰(zhàn)》（Sobieski pod Wiedniem）（1883年繪）、《韋爾內(nèi)霍拉》、《塔德烏什·柯斯丘什科在拉茨瓦維采戰(zhàn)役》（Ko?ciuszko pod Rac?awicami）（1888年繪)）、《波蘭文明史》（Dzieje Cywilizacji w Polsce）（1889年繪）和《五三憲法》（Konstytucja 3 Maja）（1891年繪）。自1890年至1892年，他也為波蘭歷代國(guó)王畫像，這些畫作被收入他的書《波蘭歷代國(guó)王像》（Portraits of Polish Kings）（1890年），他對(duì)細(xì)節(jié)的孜孜以求可以在他于1887年出席雅德維加女王開棺儀式中體現(xiàn)出來(lái)，他出席這個(gè)儀式是為了畫她的骨骼的草圖。

除了歷史事件，馬特伊科也為其他人或事作畫。這類畫中有《穿婚紗的妻子》（?ona w sukni ?lubnej）（1879年繪）、《A. 波托茨基》（1879年繪）、《S. 塔爾諾夫斯基》（1890年繪）、《自畫像》（1892年繪）。馬特伊科總共創(chuàng)作320幅油畫和幾千幅素描和水彩畫。最終，他在1889年到1991年間為圣母圣殿的紀(jì)念彩飾上色。他最著名的作品在二戰(zhàn)時(shí)被藏起來(lái)（《格倫瓦德之戰(zhàn)》則在盧布林被焚毀）。1945年后，他的大部分作品被發(fā)現(xiàn)，并得到修復(fù)。它們現(xiàn)在大多數(shù)館藏于華沙國(guó)家博物館（Muzeum Narodowe w Warszawie）。他的作品被復(fù)制成千上萬(wàn)份在世間流傳，這些作品讓他成為波蘭最著名畫家之一，幾乎成了波蘭歷史上眾多關(guān)鍵事件的標(biāo)準(zhǔn)插圖。

他較杰出的學(xué)生包括毛里奇·戈特列布、約瑟夫·梅霍費(fèi)爾、維托爾德·普魯什科夫斯基、萊昂·維丘烏科夫斯基、斯坦尼斯瓦夫·維斯皮昂斯基、伊弗雷姆·摩西·利利恩、安托尼·皮奧特羅夫斯基。