簡(jiǎn)介
哈爾濱醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院院長(zhǎng),基因組中心主任,教授,博士生導(dǎo)師。
教育經(jīng)歷
1982年本科畢業(yè)于哈爾濱醫(yī)科大學(xué);1985年獲得北京醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位;1990年日本岐阜大學(xué)微生物學(xué)博士畢業(yè)。在加拿大卡爾加里大學(xué)生物系、生化系、微生物和感染病系做研究和任教。2002年2月至2009年2月?lián)伪本┐髮W(xué)病原生物學(xué)系主任,2008年回母校哈醫(yī)大工作。
研究方向
劉樹林教授主要研究工作方向是基因組學(xué),包括微生物基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)基因組學(xué),微生物基因組學(xué)是劉樹林教授多年來(lái)的主要研究領(lǐng)域包,其中括比較細(xì)菌基因組學(xué)、沙門氏菌的分子進(jìn)化、人畜共患病感染因子宿主適應(yīng)性的遺傳基礎(chǔ)及腫瘤疫苗、HIV疫苗研究等。
主要成就
在該領(lǐng)域,劉樹林教授在世界上首次提出了細(xì)菌基因組進(jìn)化的“獲取-適應(yīng)”模型、 “遺傳開關(guān)”假說(shuō)和半封閉基因池的概念。解釋了一系列關(guān)于細(xì)菌進(jìn)化過(guò)程中的重排、宿主適應(yīng)性等等基因組學(xué)領(lǐng)域以往難以解釋的現(xiàn)象,受到了廣泛的關(guān)注,醫(yī)學(xué)基因組學(xué)是劉樹林教授正在研究的主要方向之一,將利用第二代高通量測(cè)序技術(shù),進(jìn)行基因組醫(yī)學(xué)項(xiàng)目、開展腫瘤基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、小RNA組學(xué)研究。這一研究方向?qū)槿藗冞M(jìn)一步從基因組學(xué)角度去認(rèn)識(shí)和解決遺傳疾病、腫瘤等各種比較復(fù)雜的臨床疾病奠定基礎(chǔ)。
活動(dòng)
社會(huì)活動(dòng)
American Society for Microbiology會(huì)員,Journal of Microbiology and Immunology以及International Journal of Genetics雜志編委,中國(guó)藥典委員會(huì)第8屆委員,北京微生物學(xué)會(huì)理事。在加拿大工作期間,承擔(dān)加拿大國(guó)家健康研究院(CIHR)、加拿大國(guó)家自然科學(xué)與工程研究委員會(huì)(NSERC)、Genome Canada、加拿大衛(wèi)生部、卡爾加里大學(xué)、卡爾加里實(shí)驗(yàn)室服務(wù)中心等機(jī)構(gòu)多項(xiàng)課題,回國(guó)后主持各種基金共7項(xiàng),包括國(guó)家自然基金重點(diǎn)項(xiàng)目1項(xiàng)、面上項(xiàng)目4項(xiàng)、博士點(diǎn)基金2項(xiàng),并與北京大學(xué)聯(lián)合承擔(dān)“十二五”“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項(xiàng)1項(xiàng),科研總經(jīng)費(fèi)總額達(dá)1000余萬(wàn)元。
學(xué)術(shù)活動(dòng)
在研課題共5項(xiàng)其中包括國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目1項(xiàng),發(fā)表科研文章66篇,其中SCI論文59篇,總影響因子179,科研論文陸續(xù)發(fā)表于PNAS、JB、MBE、PLoS one等該領(lǐng)域優(yōu)秀期刊,發(fā)表會(huì)議摘要50余篇,參加大型國(guó)際會(huì)議并做特邀報(bào)告12次。申請(qǐng)專利4項(xiàng)(已受理或公開),主譯著作《基因與基因組分析》,參編英文論著Horizon出版集團(tuán)出版的“Salmonella genomics and molecular biology”、Humana出版集團(tuán)“Methods in molecular biology”,參編中文論著《內(nèi)分泌與免疫藥理學(xué)》,任編委。為Genome Research、Nucleic Acids Research、Journal of Bacteriology (ASM, USA)、Microbiology (France)、Canadian Journal of Microbiology (Canada)、Genome Biology (UK)、Functional and Integrative Genomics (Germany)等30余學(xué)術(shù)期刊審閱稿件。為中國(guó)科技部(973傳染病重大項(xiàng)目)、中國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金(NSFC)、美國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金會(huì)(NSF)以及加拿大國(guó)家自然科學(xué)與工程研究基金會(huì)(NSERC)評(píng)審基金。共指導(dǎo)進(jìn)修人員8人、博士后6人;培養(yǎng)博士研究生18人、碩士研究生19人、科研本科生15人、暑期高中生3人。