孟秋為人正直；為官期間處事深得民心。在 昌黎縣令任上；曾“省徭役；興學校、平刑獄”。離任之時， 昌黎百姓上千人截道苦苦挽留，場面感人。到 大理寺任職后，曾以職方 員外郎的身份督視 山海關(guān)。由于朝政腐敗，官兵紀律廢弛，一些為非作歹者任意出入關(guān)禁而無人敢阻。孟秋赴任后，立即對守關(guān)邊軍進行整頓，嚴格軍紀與關(guān)禁，深得當?shù)剀娒駳g迎。著名學者焦蛇贊譽他：“篤學力行，苦節(jié)清修。以名儒特聞，以廉吏令終。治縣縣治，治獄獄理，司馬馬蕃， 司刑 刑清，司璽璽慎，投之所向，恢恢乎游刃而解”。孟秋為官清廉，敢于直言；因此得罪一些官員。

萬歷九年(1581)，京察中他受到一些人的攻擊，罷官回鄉(xiāng)。歸途中與妻子共駕一輛破牛車，沒有一件值錢的財產(chǎn)，沿途百姓皆為之嘆息。巡撫 都御史 許孚遠平日與孟秋要好，孟秋回鄉(xiāng)后他曾去孟家拜訪。所見孟秋的住房僅是幾根緣木支撐的茅屋，破陋不堪，唯有大批書籍堆置房中，孟秋每日在書堆中勤奮讀書。 許孚遠見此，感慨萬分，稱“孟我疆風味，大江以南未有也”。孟秋是同鄉(xiāng)知名學者 張后覺的弟子，在學問上也多承其師。

他與 河南知名學者 孟化鯉過往甚密，經(jīng)常在一起切磋學問，影響較大。 黃宗羲稱 二孟(孟秋、 孟化鯉)如“冰壺秋月，兩相輝映，以扶家傳于不墮，可稱北地聯(lián)璧”，給予很高評價。孟秋在學術(shù)上主張 王陽明“致良知說”，反對 程朱理學“存天理，滅人欲”。他認為，“人欲無窮，去一日，生一日；去一年，生一年；終生去欲，終生多欲，勞苦煩難，何日是清凈寧一時耶?”他贊成良知說，認為“良知未有不現(xiàn)成者”。他舉一個防備盜賊的例子，說如果“家無長物，空空如也，吾且高枕而臥，盜賊自不擾我，又何用未來則防、即來則逐乎？”孟秋強調(diào)的是追求良知速成說，實際上也是摻和了佛教禪宗的頓悟說，被人稱為是“禪學化的 王學”。但這種學說的影響在 山東僅限于魯 西北地區(qū)，在山東其它地區(qū)，傳統(tǒng)的 程朱理學仍占據(jù)主導地位。