莊存與官至禮部左侍郎，歷任湖南、 順天、山東學(xué)政。典湖北、浙江鄉(xiāng)試各二次，又充天文、算法總裁官及樂部大臣。先后直上書房、南書房近四十年。以年老致仕。 莊存與家學(xué)有 莊述祖、莊綬甲、莊有可承傳。其弟子有 邵晉涵、 孔廣森等。其私淑弟子有 劉逢祿、宋翔風(fēng)等。

方耕學(xué)派治經(jīng)學(xué)，但“不斤斤分別漢宋，但期融通圣奧，歸諸至當(dāng)”；此派提倡今文經(jīng)學(xué)，但不絕對排斥古文經(jīng)學(xué)。 莊存與“于六經(jīng)皆能闡發(fā)奧旨，不專事箋注而獨得先圣微言大義于語言文字之外。《易》則貫串群經(jīng)，雖旁涉天官、分野、氣候，而非如漢宋諸儒之專衍術(shù)數(shù)，比附史事；《尚書》則不分今古文文字異同，而剖析疑義，深得夫子序書、孟子論世之意、《詩》則詳于變雅，發(fā)揮大義，多可陳之講筵；《春秋》則主公羊、董子，雖略采左氏、谷梁氏及宋元諸儒之說，而非如何助公所譏倍經(jīng)任意反轉(zhuǎn)違戾；《周官》則博考載籍有道術(shù)之文為之補其亡闕，侮能取法致用；《樂》則譜其聲，論其理，足補樂經(jīng)之闕；《四書說》敷暢本旨，可作考亭爭友，而非如姚江王氏、蕭山毛氏之自辟門戶、輕肆低詰也。而要于《春秋》為最探”（ 徐世昌《清儒學(xué)案》）。因其“所學(xué)與當(dāng)時講論或構(gòu)鑿不相人，故所撰述皆秘不示人，通其學(xué)者，僅門人 邵晉涵、 孔廣森及子孫數(shù)人而已”。

時《古文尚書》二十八篇經(jīng) 閻若璩等考證，已證明為偽書，但 莊存與仍主張將此列于學(xué)官，他指出：“辨古籍真?zhèn)�，為術(shù)淺且近，且于下學(xué)僮盡明之矣。古籍墜湮什之八，頗藉偽書存者什之二�！洞笥碇儭窂U，人心道心之旨、殺不辜寧失不經(jīng)之道亡矣；《大甲》廢，儉德永圖之訓(xùn)墜矣；《仲虺之誥》廢，謂人莫己若之誡亡矣；《說命》廢，股肱良臣啟沃之誼喪矣；《旅獒》廢，不寶異物賤用物誡亡矣；《閻命》廢，左右前后皆正人之美失矣。”（龔自珍《神道碑》）

關(guān)于其弟子學(xué)術(shù)宗旨，阮元曾提出異議，“阮文達序方耕經(jīng)說云：通其學(xué)者，門人邵學(xué)士、孔檢討及子孫數(shù)人而已。然邵氏學(xué)派實不相同；孔氏同治公羊?qū)W，而三科九旨別自為說，宗旨亦異。蓋莊氏之學(xué)，唯傳于家，再傳為劉氏逢祿、宋氏風(fēng)翔益著。面對氏、宋氏生晚亦非親炙也”。

劉逢錄（1775~1829），字申受，號思誤居士， 莊存與外孫。“得其外家之傳，于《春秋》獨發(fā)神悟。嘗謂諸經(jīng)中知類通達、徽顯闡幽者，厥唯《公羊》一書。 董仲舒之所傳，何助公之所釋，徽言大義，一發(fā)千鈞。于是研精覃思，探原 董生，發(fā)揮何氏，尋其條貫，正其統(tǒng)紀(jì)，為《何氏釋例》十卷。又析其凝滯，為《何氏解詁箋》一卷、《答難》二卷、《發(fā)墨守評》一卷，又推勘左氏、谷梁氏之得失，為《左氏春秋考證》一卷、《箴膏盲評》一卷、《谷梁廢疾申何》二卷。又?jǐn)嘀T史刑禮之不中者，為《議禮決獄》二卷。又推其意，為《論語述何》二卷、《緯略》一卷、《春秋賞罰格》二卷。凡為《春秋》之書十有余種。又以東漢經(jīng)師有家法可尋者，今唯何、虞、許、鄭四君子”（ 徐世昌《清儒學(xué)案》）。

宋翔風(fēng)（1776~1860），字 于庭，亦莊存與外孫。翔風(fēng)通訓(xùn)詁名物，志在西漢家法、微言大義。以為《論語》二十篇備孔子之業(yè)，故綜核古今為《論語說義》十卷、《論語鄭注》二卷。時《孟子》一書唯 趙歧注盛行于世，因參考近儒論說，正其疏鐘，撰《孟子趙注補正》六卷。又撰《孟子劉熙注》一卷。此學(xué)派代表著作，除上述者外，還有 莊存與《家傳論》、《象象論》、《系辭傳論附序卦傳論》、《八卦觀象解》、《卦氣解》、《尚書既見》、《尚書說》、《毛詩說》、《周官記》、《周官說》、《春秋正辭》、《春秋舉例》、《春秋要指》、《樂說》、《四書說》（以上統(tǒng)名曰《味經(jīng)齋遺書》，又有《味經(jīng)齋文稿》若干卷），劉逢錄《今古文尚書集解》、《詩聲衍》、《毛詩譜》、《詩說》、《庚辰大禮記注長編》、《八代文苑》、《劉禮部集》，宋翔威《小爾雅訓(xùn)纂》、《周易考異》、《卦氣解》、《尚書略說》、《尚書譜》、《大學(xué)古義說》、《四書釋地辨證》、《爾雅釋服》、《五經(jīng)要義》、《過庭錄》、《論語發(fā)徽經(jīng)問》、學(xué)齋札記》（以上統(tǒng)名曰《浮溪精舍叢書》）等。

徐世昌《清儒學(xué)案》評方耕學(xué)派曰：“在乾隆諸儒中實別為一派，家學(xué)流傳熏陶者眾，猶子述祖及外孫劉逢錄、宋翔風(fēng)輩，皆湛深經(jīng)術(shù)， 卓然成家，其淵源蓋有自也。”