中華人民共和國成立后，南京音樂學(xué)院并入天津中央音樂學(xué)院，李佺民隨院到津。1951年，赴抗美援朝戰(zhàn)爭前線體驗(yàn)生活。創(chuàng)作了《上戰(zhàn)場》、《肩上槍、亮堂堂》等歌曲。1952年他從音樂學(xué)院畢業(yè)后，留學(xué)院民族音樂研究所民間音樂研究室工作。1954年《毛主席派來訪問團(tuán)》（合唱曲）灌制成唱片，被很多刊物和演出團(tuán)體選用。他還編輯整理了《河南曲子板頭曲選》、《河南曲子演出介紹》、《福建民間音樂采訪報(bào)告》、《中國民歌選》（第二集）、《民歌改編工作總結(jié)》、《民間音樂采訪手冊》等。1959～1979年，他先后任《中國近現(xiàn)代音樂史綱要》、《中國民間歌曲集成》、《歐洲音樂史》等書的編輯組長。

1980年起，李佺民任音樂研究所副所長。為《大百科全書》（音樂卷）、《中國音樂詞典》撰寫條目，任近現(xiàn)代音樂分支副主編，并擔(dān)任《中國音樂詞典》分科主編。他還修訂了《民族音樂概論》。多年來，他先后發(fā)表了《談音樂的民族性和時(shí)代性》、《學(xué)習(xí)冼星海同志的群眾歌曲創(chuàng)作》等30多篇論文，創(chuàng)作、改編歌曲20余首，領(lǐng)導(dǎo)并參加撰寫、修訂大型史、論著5部。李佺民還曾任中國藝術(shù)研究院音樂研究所副所長、副研究員，中國音樂家協(xié)會理論委員會委員，聶耳冼星海學(xué)會會員。1983年身患重病后，仍堅(jiān)持接待外賓，參加《中國音樂詞典·續(xù)編》主編會議，最后還趕寫出近現(xiàn)代音樂史陳列方案。同年7月逝世。