林蒼祐于 1919年 5月28日出生在英屬 海峽殖民地 檳城，父親 林萃龍是醫(yī)生， 1937年被授予太平局紳；母親為 謝瑞云。其家庭祖籍為 中國(guó) 福建 同安 廈門(mén)，后來(lái)移民至 新加坡，在 林萃龍時(shí)搬至 檳城。林蒼佑為家庭中第二個(gè)小孩，有一個(gè)姐姐與許多弟妹。

林蒼祐就讀于哈珍學(xué)校（Penang Hutching School），后來(lái)升上檳城大英義學(xué)（Penang Free School），他于 1937年獲得英國(guó)皇家獎(jiǎng)學(xué)金（King’s Scholar）。 1944年，他于 英國(guó) 蘇格蘭 愛(ài)丁堡大學(xué)獲得外科醫(yī)學(xué)學(xué)位。

在畢業(yè)之后，他到了 中國(guó)，任職中華民國(guó)海軍總部醫(yī)務(wù)處長(zhǎng)兼任中華民國(guó)國(guó)防部部長(zhǎng) 陳誠(chéng)的私人醫(yī)生。他在中國(guó)也認(rèn)識(shí)了吳欣燕，他們于 1947年在 香港結(jié)婚。之后他們回到檳城。

他于 1951年開(kāi)始參與政治，被任命為檳城殖民地議員（Penang Local Council），并在同年 6月19日與其他發(fā)起人創(chuàng)建檳城急進(jìn)黨（Penang Radical Party），并擔(dān)任副主席一職。 1953年，他成為檳城急進(jìn)黨黨主席。他也于 1953年參選市政局的議員，但是并沒(méi)有當(dāng)選。 1954年，林蒼佑決心與 馬來(lái)西亞華人公會(huì)合作，并于 1954年 6月27日將檳城急進(jìn)黨改名為“急進(jìn)黨”，并以個(gè)人名義加入 馬華公會(huì)。 1955年，他贏得選舉成為檳州立法議會(huì)的議員之一，并為聯(lián)盟首席議員（Federal Legislature）。

1958年 3月23日的 馬華公會(huì)黨內(nèi)選舉中，林蒼佑挑戰(zhàn)原任總會(huì)長(zhǎng) 陳禎祿，以89對(duì)67票的22票優(yōu)勢(shì)贏得總會(huì)長(zhǎng)的職務(wù)。

1958年3月23日，他在馬華黨選中挑戰(zhàn)創(chuàng)黨人陳禎祿。以89票對(duì)67票擊敗陳禎祿榮任第二任馬華總會(huì)長(zhǎng)。他銳意改革馬華卻遇黨內(nèi)外重重阻力，更因爭(zhēng)取華人議席之分而與巫統(tǒng)鬧翻，進(jìn)一步激化馬華黨內(nèi)的斗爭(zhēng)，演變成陳禎祿父子與林蒼佑派的對(duì)峙，最終林蒼佑派以失敗而離開(kāi)馬華。1961年離開(kāi)了馬華公會(huì)，林蒼佑在同年（1961年）在芙蓉創(chuàng)建民主聯(lián)合黨。由于陳世英等人的加盟，民主聯(lián)合黨間接成為芙蓉市議會(huì)的執(zhí)政黨。1963年林蒼佑與民聯(lián)黨鬧分裂，只得撤回檳城。1964年民聯(lián)黨參加全國(guó)大選，僅林蒼佑一人當(dāng)選國(guó)會(huì)議員，其他當(dāng)選州議員都是在他的國(guó)會(huì)選區(qū)或邊周地帶勝出。1968年林蒼佑率領(lǐng)民聯(lián)黨加入了新成立的民政黨，竟而在1969年的大選中躍居以反對(duì)黨身份成為檳州執(zhí)政黨。當(dāng)上檳州首席部長(zhǎng)。1972年，在經(jīng)歷513種族暴亂后，民政與聯(lián)盟（巫統(tǒng)）組檳州聯(lián)合政府。1974年林蒼佑率領(lǐng)民政黨加入國(guó)陣，并在往后的大選又再勝出。1990年大選，林蒼佑以八百多張票敗在 林吉祥手中，從此退出政壇。為了表?yè)P(yáng)林蒼佑對(duì)檳州政經(jīng)所帶來(lái)的貢獻(xiàn)，馬來(lái)西亞統(tǒng)治者冊(cè)封他為敦。英國(guó)愛(ài)丁堡大學(xué)后來(lái)對(duì)這位杰出校友也授予榮譽(yù)博士。