人物生平
余啟元祖籍婺源鄣村，生于嘉靖（1543年），嘉靖四十年（1561年）入縣學(xué)，嘉靖四十年（1563年）補(bǔ)廩膳生，隆慶元年（1567年）中丁卯科應(yīng)天府鄉(xiāng)試舉人，萬(wàn)歷二年 （1574年） 中甲戌科殿試三甲賜同進(jìn)士出身一百二十八名。
戶(hù)部觀(guān)政一年后，于萬(wàn)歷三年授浙江麗水知縣（正七品），但在族祖余一龍的幫助下，改授北直隸黃縣知縣。后因母親生病馳歸，赴任違限，被謫湖廣都司、署嘉魚(yú)知縣。萬(wàn)歷五年，升北直隸臨城知縣。萬(wàn)歷十年父親過(guò)世，丁憂(yōu)三年后于萬(wàn)歷十三年起補(bǔ)原官。萬(wàn)歷十四年因不肯新丈田土，被謫為霸州學(xué)正（正九品），謝病歸鄉(xiāng)。
萬(wàn)歷二十八年，在家居十五載后，余啟元起復(fù)為山東武定州學(xué)正，轉(zhuǎn)任國(guó)子監(jiān)助教（從八品）；二十九年遷升為戶(hù)部廣東司主事（正六品），并于三十年奉勅監(jiān)兌江西漕糧；四十二年兼都易州糧儲(chǔ)，大計(jì)為天下，被譽(yù)為“清廉第一”，三十三年、三十五年分別升為北京光祿寺丞（從六品）、少卿（正五品）；三十八年轉(zhuǎn)南直隸大理寺丞署本寺卿，總督糧儲(chǔ)，通政使司通政使三印，四十一年遷南京鴻臚寺卿。四十四年會(huì)推通政使司通政使，以族弟余懋孳在禮部回避，并于四十七年告歸鄉(xiāng)里。
泰昌元年（1620年）復(fù)起為北京鴻臚寺卿，三疏告病，改授南京太常寺添注少卿，并在天啟二年（1622年）升大理寺卿。因年登八十，晉階資治尹，予告致仕，崇禎六年（1633年）卒于家中，享年九十一歲。
主要成就
余啟元在奉命監(jiān)督江西糧運(yùn)時(shí)，努力減少虛耗40萬(wàn)石。在監(jiān)督河北易州糧儲(chǔ)時(shí)，被譽(yù)為“清廉第一”。他督辦糧政，敢于查處貪官污吏，對(duì)自身要求很?chē)?yán)，只允許每天支十?dāng)?shù)文錢(qián)買(mǎi)茶解渴，不準(zhǔn)公款揮霍。當(dāng)時(shí)京城有歌謠云：“誰(shuí)言南儲(chǔ)如山積，余公十文買(mǎi)水吃�！北蛔鳛椤袄韺W(xué)名臣”在鄉(xiāng)祠奉祀。
親屬成員
族弟：余懋孳，歷任觀(guān)政都察院、浙江山陰知縣、浙江鄉(xiāng)試同考官、北京禮科給事中、會(huì)試同考官等；
兄弟：余太元，曾任經(jīng)歷。