小田氏是宇都宮氏庶流，其祖上乃是擔任過鐮倉幕府十三人合議眾的八田知家，知家于文治元年（公元1185年）出任常陸國守護時，修筑了小田城，其后代也改稱小田氏。

小田氏治之父為小田氏第14代當主小田政治，其子有小田友治、小田守治，其女后來嫁與結城秀康（德川家康次子同時也是豐臣秀吉養(yǎng)子）作為側室。

天文17年（1548年），其父小田政治去世，氏治遂繼承小田氏家督。

在繼任家督之初，氏治面臨的最大威脅來自下總國結城城的結城政勝。結城政勝于氏治繼承家督當年便首先策反了小田氏屬下真壁城城主真壁久干，然后又降伏了下妻城城主多賀谷政經，此后更是與北條氏康交好，從而獲得了后北條氏的鼎力支持。

弘治元年（1555年），氏治聯合常陸太田城城主佐竹義昭共同出兵，進攻與北條氏康交結的結城政勝。次年，結城政勝在北條氏康派遣的援軍太田資正、遠山綱景的支持下，反攻小田氏。氏治率兵迎擊，卻在海老島之戰(zhàn)中兵敗，不僅海老島城，連自己的居城小田城都被占奪。

但為了抑制北常陸國的佐竹義昭，北條氏康此后又與氏治達成和解，并在弘治2年（1556年）8月，派兵幫助氏治奪回了小田城。

弘治3年（1557年）2月，佐竹義昭聯合多賀谷政經進攻由小田氏家臣平冢自省據守的海老島城，氏治率軍迎敵，但再次被擊敗，遂放棄小田城逃往土浦城。直到永祿2年（1559年）4月，才由家臣菅谷政貞奪回小田城。

同年8月，結城政勝病死，其子結城明朝也病勢危急。氏治便于9月起兵準備奪取結城城，但遭到了結城政勝之兄小山高朝的抵抗，并被結城家有“鬼真壁”之稱的真壁氏干擊潰，倉皇退軍。結城軍隨即反攻，奪取了小田氏的北條城。于此同時，佐竹義昭趁亂再次聯合多賀谷政經進攻并奪取了海老島城。

永祿3年（1560年），與北條氏康敵對的越后大名上杉謙信初次出兵關東，并邀請關東諸大名一同出軍討伐后北條氏。包括小田氏治在內的幾乎所有關東大名都倒向了上杉謙信，唯有結城政勝的繼承人、結城氏現任當主結城晴朝仍然與后北條氏結盟。次年，氏治聯合佐竹義昭、小山義高一共出動七千兵力進攻結城城。結城氏重要家臣多賀谷政經反叛，結城晴朝陷入孤立局面，只好選擇降伏。

永祿4年（1561年），上杉謙信率軍進攻北條氏康居城小田原城，氏治也參與此役，但最后謙信并未能夠等到攻下小田原城就退回越后。次年6月，在北條氏康的勸誘下，氏治反叛上杉謙信，倒向了后北條氏的懷抱。

當時，氏治正與常陸國中部勢力府中城城主大掾貞國敵對，貞國因為親緣的關系受到了佐竹義昭的支援。

永祿6年（1563年），上杉謙信再次出兵關東討伐后北條氏，佐竹義昭親率軍隊前去與上杉軍匯合。氏治看準時機，進攻失去依靠的大掾貞國，在三村之戰(zhàn)中擊敗了貞國，并與下野國的那須資胤、結城晴朝結盟，共同抵抗佐竹義昭。

永祿7年（1564年）4月，佐竹義昭、宇都宮廣綱、真壁氏干聯名致書上杉謙信，指責氏治的背叛行徑。上杉謙信得書后，立即起兵討伐小田氏。由于對上杉軍的行軍速度估計錯誤，當聞知上杉軍已攻入小田氏領內時，氏治大驚失色，立即拼湊起了3千軍隊應戰(zhàn)。在山王堂之戰(zhàn)中氏治打敗，居城小田城再次失陷，氏治逃往藤澤城。

永祿8年（1565年）12月，佐竹義昭病死后佐竹氏發(fā)生內亂，氏治趁機又奪回了小田城�？墒呛镁安婚L，次年2月，上杉謙信再度出兵討伐小田氏，氏治再度放棄小田城。

永祿10年（1567年）5月，氏治求援于甲斐武田信玄討伐佐竹義重。

永祿11年（1568年），氏治通過結城晴朝向上杉謙信表示降伏，在獲得認可后，收回小田城。

永祿12年（1569年）5月，佐竹義重進攻小田城，氏治率軍將其擊退。11月，氏治進攻佐竹氏家臣太田資正據守的片野城，卻反遭真壁氏干擊敗。

元龜元年（1570年）8月，自父輩起就為世仇的結城晴朝聯合多賀谷重經入侵小田氏領地，在兵力處于劣勢的情況下，氏治派遣家臣菅谷政貞夜襲敵軍，取得大勝。

元龜4年（1573年）元旦，趁著前一天因連歌會而防守松懈，太田資正率佐竹軍奇襲小田城，氏治不敵敗逃，此戰(zhàn)中小田氏家臣北條氏高也為佐竹軍策反。氏治立即起兵5千5百擊破佐竹軍，又奪回了小田城。2月，義重派遣多賀谷重經攻取小田氏的大島城，守將戰(zhàn)死，但氏治于月內便發(fā)動夜襲奪回了大島城。

但是在后來的手這坂之戰(zhàn)中，佐竹義重、太田資正再次攻陷了小田城，氏治逃往土浦城，此后又逃往藤澤城。太田資正進入小田城之后，派遣其子梶原景國同北條治高繼續(xù)進攻藤澤城。小田軍開始戰(zhàn)敗，但在氏治親自出馬下，后來轉敗為勝，擊退了佐竹軍。

天正元年（1573年）4月，佐竹軍再次進攻藤澤城，在氏治的再次出馬下，又一次擊敗了佐竹軍。

雖然兩次擊敗了佐竹軍，但是7月、8月小田氏連續(xù)丟失穴倉城和戶崎城。氏治決定從防守較弱的藤澤城遷往土浦城以防御佐竹氏的進攻。9月，小田氏遭到了佐竹軍的兩面進攻，太田資正、梶原景國父子攻打藤澤城，北條高廣、真壁氏干攻打土浦城。小田氏從城內出兵，雙雙擊退來敵，受到兩面勝利的鼓舞，氏治再次燃起了奪回小田城的雄心。小田軍又于隨后發(fā)生的君島川之戰(zhàn)中再破佐竹軍，一度迫近小田城，但在佐竹氏援軍的防御下，還是未能奪回小田城。11月，佐竹軍逆轉戰(zhàn)局，太田資正、梶原景國、真壁氏干、北條高廣合軍2千，攻陷了小田氏的藤澤城。

在藤澤城失陷后，佐竹軍把目標指向了土浦城。根據記載，土浦城北有騎兵難以行進的沼澤地，西有大河，南靠霞浦湖，歷來便是易守難攻之城。

天正元年（1573年）12月，佐竹軍圍困土浦城，次年1月，佐竹義重更是加派車斯忠前來支援。氏治嫡子小田守治一度打開城門率兵3百沖入敵陣奮勇殺敵，但是兵力上的差距使得結果變得毫無懸念。2月，氏治夜遁，土浦城遂被攻陷。

土浦城陷落后，小田氏將領或死或降，氏治處于明顯的劣勢。雖然如此，氏治并沒有受到過致命的打擊，所以依然保有再起可能。

由于氏治的庶長子小田友治出仕于北條氏政，所以氏治開始轉向后北條氏尋求幫助。

天正2年（1574年）11月，北條氏政、氏照兄弟率軍兩萬進攻下總國的關宿城。但在途中遭遇漲水的利根川而無法進軍，遂應友治的請求轉而進攻土浦城。土浦城守將乃是本來屬于小田氏的菅谷政貞，政貞在與氏治秘密聯絡表明心意后不戰(zhàn)而降，氏治遂奪回了土浦城。

天正5年（1577年），在北條氏政以及千葉氏、相馬氏、江戶氏的幫助之下，氏治逐漸收復了失地，再次開始了與佐竹義重的對抗。

天正6年（1587年）7月，小田氏領下木田余城被梶原政景攻陷，隨后，氏治派菅谷范政（政貞之子）奪回了木田余城，但此后再次被佐竹軍攻陷。

天正8年（1580年）8月，北條氏政派其弟北條氏照、北條氏邦率兵進攻常陸，并在氏治家臣的帶領下攻陷了之前被佐竹氏奪取的谷田部城，然而佐竹氏的多賀谷重經又奪回了谷田部城。

此后，失去了后北條氏援助的小田氏無法再與佐竹氏較量，然而因為小田氏善戰(zhàn)的家臣輔助，佐竹氏也無法吞并小田氏。

有說法稱天正11年（1583年）2月13日，在佐竹軍的進攻下，氏治最終以其孫金壽丸為人質降伏于佐竹氏，但是此種說法頗受質疑。

天正18年（1590年），再次燃起奪回小田氏世代領地信念的氏治再次出兵進攻小田城。小田城守將是梶原景國、太田資胤兄弟，氏治率軍在城外與佐竹軍交戰(zhàn)并取得優(yōu)勢，一度迫近小田城。就在此時，得到求援的太田資正率軍趕到，雙方再次發(fā)生激戰(zhàn)，結果佐竹軍在付出較大傷亡代價下還是堅守住了小田城。

氏治也向北條氏政求援，但是此時北條氏政正忙于應對豐臣秀吉發(fā)動的小田原征伐戰(zhàn)，根本無暇顧及氏治的請求。更糟糕的是，豐臣秀吉在滅亡后北條氏后，又以“未參加對北條氏的討伐行動，且與豐臣氏盟軍佐竹氏為敵”為由，沒收了氏治的所有領地。多年來一直在諸強大勢力的夾縫中艱難尋求生機的小田氏最終滅亡，屢戰(zhàn)屢敗、屢敗屢戰(zhàn)的關東不死鳥就此折翼。

天正19年（1591年），氏治通過淺野長政向秀吉謝罪，在得到秀吉許可后，投靠了其女婿結城秀康。

后來結城秀康轉封，氏治和其子守治一同跟隨前往越前國，同時庶長子友治也出仕于結城家。

慶長7年（1602年）11月13日去世，享年69，法名南江道薰天庵大居士，葬于越前國永平寺，后來歸葬常陸國新善光寺。