光緒二十四年（1898）正月，南學(xué)會(huì)在長沙開講，樊錐旋即在邵陽組織南學(xué)會(huì)分會(huì)，被舉為分會(huì)會(huì)長。他手訂邵陽南學(xué)會(huì)分會(huì)章程，主張對“一切拘迂狹隘之見，概宜屏除”，“力除一切浮華囂張之習(xí)”，提倡 民權(quán)平等之說。其舊時(shí)同學(xué) 蘇輿見之，乃撰《駁南學(xué)分會(huì)章程條議》，攻擊他倡“平等邪說”，是“無尊卑親疏”，呼吁南學(xué)分會(huì)對他予以“處治”。樊錐持之益堅(jiān)，并表示“生死不能奪其志，貴賤不能換其幟”。同年二月十五日，《 湘報(bào)》創(chuàng)刊，他為主要撰稿人之一。先后在《 湘報(bào)》上發(fā)表《開誠篇》、《發(fā)錮篇》、《勸湘工》等文，持論激烈，傳誦一時(shí)。提倡資產(chǎn)階級 民權(quán)、平等和立憲之說，要求將“一切用人行政，付之國會(huì)議院”，“使人人有自主之權(quán)，人人以救亡為事”。他主張維新不能只靠少數(shù)人，要啟迪民智，造就眾多新人，說：“天下之理，天下公之，天下之事，天下公之”，“如欲存中國，則不可不和眾，不可不多人”，否則“積習(xí)于下，而新者一二，不新者千百，阻之者又億萬”，如是變法維新即不能奏效。他還提出變法維新要徹底：“一切繁禮細(xì)故、猥尊鄙貴、文武名場、惡例劣范、 銓選檔冊、謬條亂章、大政鴻法、普憲均律、四民學(xué)校、風(fēng)情土俗，一革以前，搜索無剩，唯泰西者是效�！焙粲酢按笈d藝學(xué)，眾建學(xué)堂，宏創(chuàng)工廠，當(dāng)購機(jī)器，廣選西法，多聘西師”，以發(fā)展中國民族工業(yè)。并認(rèn)為工是“勸商之本”，只要“工藝能盛”，自然“貨可不洋”，可以抵拒“洋貨”之傾銷。又憤怒斥責(zé)“傲然自大，頑冥不靈”的“群寮”、“群丑”和“深閉固拒”的封建 頑固派，抨擊其“礙事梗議”，“稍有新政新學(xué)，必萬端阻撓，萬端梗塞，使之已行者撤，將行者歇，未行者缺”。提出應(yīng)該將此類“死人”“網(wǎng)羅凈盡”，不能讓其“控制生人”。

同時(shí)，樊錐與 熊希齡、 譚嗣同等發(fā)起組織湖南不纏足會(huì)，提倡婦女放足，革除千百年來婦女纏足舊風(fēng)俗，以振興國家，解放婦女。并擔(dān)任董事。此議頗得社會(huì)支持，一時(shí)在《 湘報(bào)》上題名加入不纏足會(huì)者即有數(shù)千人，不少州縣都成立分會(huì)。

樊錐在湖南 維新運(yùn)動(dòng)中言行激烈，遭到封建守舊分子忌恨。 王先謙、 葉德輝及其門弟子等勾結(jié)邵陽劣紳，攻擊樊錐為“首倡邪說，背叛圣教，敗滅倫常，惑世誣民”的“亂民”，將其驅(qū)逐出境。不久， 戊戌政變發(fā)生，因匿處深山，幸免于難。

光緒二十六（1900）秋， 唐才常組織自立軍起義，樊錐曾參與其事。起義失敗后，間關(guān)走上海，與 陳范等主辦《蘇報(bào)》。二十九年《蘇報(bào)》案發(fā)生，他避禍走日本，改名時(shí)中。初入 成城學(xué)校，旋以體弱不適，改習(xí)法政。后在黃興、 陳天華等影響下，傾向革命。三十年返國，參與華興會(huì)長沙起義。事敗后，改名誠亮，入南京軍校任教。稍后，應(yīng) 蔡鍔邀至廣西，入陸軍小學(xué)任教。三十一年冬，因病返湘。次年春逝世，年僅35歲。今人輯有《樊錐集》行世。

《湖南省志 人物志》