蕭雅全1967年12月20日生于臺北，1988年進(jìn)入國立藝術(shù)學(xué)院美術(shù)系就讀時，開始拍攝實(shí)驗(yàn)短片，第一部是《型態(tài)》，1989年拍了《節(jié)拍器》和《告白》，已展現(xiàn)出影像創(chuàng)作能力。 1990年蕭雅全推出第四部實(shí)驗(yàn)短片《五個鏡頭》，該片描述一個房間里所發(fā)生的事情，五個朋友共同策劃著一出戲劇，攝影機(jī)則扮演他們各自的觀點(diǎn)。

在這些線索交織下，存在幾種合理的可能。本片內(nèi)容近故事劇敘述，影像造型結(jié)構(gòu)細(xì)心，但由于整體節(jié)奏的控制多有瞻顧，稍嫌冗長。另外雖然能利用媒體特性，但表現(xiàn)手法鋪陳堆砌。本片獲1990年第2屆金帶獎最佳造型藝術(shù)佳作獎。

1991年蕭雅全從國立藝術(shù)學(xué)院畢業(yè)，拍攝《二又六分之一》，獲第14屆金穗獎最佳實(shí)驗(yàn)片錄像帶獎。1993年“電影年”活動設(shè)電影創(chuàng)作培訓(xùn)班，蕭雅全和林正盛、陳玉勛同時加入該班受訓(xùn)，頗得焦雄屏老師的賞識。

1994年蕭雅全創(chuàng)作29分鐘短片《倒數(shù)契約》，入選同年金馬獎國際影展觀摩片，及1995年第18屆金穗獎優(yōu)等短片。1995年12月編導(dǎo)了長度為5分鐘的實(shí)驗(yàn)錄像帶《杠在那兒》，更博好評。該片由林哲強(qiáng)攝影、侯志堅(jiān)音樂，描寫1995年的臺灣是什么樣子。本片為1996年第一屆釜山國際影展觀摩作品，并獲得1996年第19屆金穗獎最佳實(shí)驗(yàn)錄像帶獎。

1998年蕭雅全擔(dān)任侯孝賢電影《海上花》的副導(dǎo)演。2000年蕭雅全編導(dǎo)了自己的第一部劇情長片《命帶追逐》。該片獲新聞局88年度(1999年)500萬元國片輔導(dǎo)金，由長澍視聽傳播公司出品，片長72分鐘，由侯孝賢監(jiān)制，李俊杰、范筱梵、王沛萁主演，并獲2000年臺北電影節(jié)商業(yè)推薦評估獎最佳影片、導(dǎo)演新人獎，第15屆(2001年)日本福岡電影節(jié)亞洲電影首獎，為第54屆(2001年)戛納國際電影節(jié)導(dǎo)演雙周單元金攝影機(jī)獎參選片，第25屆(2001年)香港電影節(jié)觀摩影片。

2010年，蕭雅全導(dǎo)演電影《第36個故事》（英文名為：Taipei Exchanges），榮獲2010臺北電影節(jié) 觀眾票選獎、最佳音樂獎 。該片監(jiān)制為侯孝賢，故事溫馨甜蜜，耐人尋味。

2018年7月14日，憑借《范保德》獲第20屆臺北電影獎最佳導(dǎo)演獎。8月17日，執(zhí)導(dǎo)、編劇的電影《范保德》在中國臺灣上映。