他自幼聰慧出眾，拜師學藝，日漸長進，22歲時即練出飛檐走壁的武功。1937年12月下旬，淄川淪陷。孫錫九面對野蠻欺凌淄川人民的侵略軍，義憤萬端，立下了殺敵救國的誓愿。他天天背糞筐，懷揣匕首，伺機殺敵。1939年入伍，被編入八路軍山東人民抗日游擊第四支隊先遣第一梯隊參謀處。12月調(diào)四支隊特務(wù)團工作，曾多次出色完成偵察任務(wù)，受到支隊首長的表揚。

1940年2月28日，孫錫九所在特務(wù)團奉命夜襲博山、萊蕪邊境重要隘口青石關(guān)日軍據(jù)點。戰(zhàn)斗打響，特務(wù)團以聲東擊西的戰(zhàn)法吸引敵人火力，孫錫九從側(cè)面迅速插入據(jù)點他冒著隨時可能犧牲的危險，獨自三次飛躍電網(wǎng)，擲彈炸碉堡，炸死敵人20余名。當最后一次跨躍電網(wǎng)時，戰(zhàn)友們勸他不要再去炸了，孫錫九毅然決然地說：“怕啥!豁上一條命，也得把敵人全部消滅!”碉堡內(nèi)的殘敵發(fā)現(xiàn)了他，用猛烈的火力擊傷他的腿，他忍痛擰身竄上碉堡，投下了最后一顆手榴彈。此時，他身受重傷，已無力躍出敵人的電網(wǎng)，日軍吶喊著撲過來要活抓他。在這千鈞一發(fā)之際，他吃力地支撐著踉蹌欲倒的身軀，掏槍撂倒了一個日軍，然后槍口對準自己，打響了最后一槍。