個(gè)人簡(jiǎn)介
北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)中心研究員、博士生導(dǎo)師。入選首批青年拔尖人才，亞太生物信息網(wǎng)絡(luò)(APBioNet)執(zhí)行理事會(huì)委員。
研究?jī)?nèi)容
隨著以深度測(cè)序?yàn)榇淼母咄可锛夹g(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用，各種生物學(xué)大數(shù)據(jù)以指數(shù)增長(zhǎng)大量涌現(xiàn)。這些數(shù)據(jù)之中蘊(yùn)藏著大量的寶藏，即生物學(xué)的新規(guī)律、新發(fā)現(xiàn)。但是，這些海量的、指數(shù)增長(zhǎng)的、并且高噪聲的生物數(shù)據(jù)也帶來(lái)了巨大的數(shù)據(jù)分析技術(shù)上的挑戰(zhàn)。
課題組以生物信息學(xué)分析技術(shù)、方法與平臺(tái)開(kāi)發(fā)為基礎(chǔ)，通過(guò)綜合運(yùn)用大數(shù)據(jù)與統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)(statistical learning)等計(jì)算方法，整合高通量遺傳學(xué)與功能基因組學(xué)數(shù)據(jù)，探索新表達(dá)調(diào)控因子的功能與演化及其對(duì)生物體新性狀和新功能的貢獻(xiàn)。
課題組主要研究方向：
1) 非編碼RNA對(duì)干細(xì)胞命運(yùn)決定過(guò)程的調(diào)控
2) 基因組中適應(yīng)性基因獲得/丟失對(duì)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)演化的影響
工作經(jīng)歷
2011 - , 研究員 , 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
2008 - 2010 , 副研究員 , 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
社會(huì)服務(wù)工作
APBioNet(Asia Pacific Bioinformatics Network,亞太生物信息學(xué)網(wǎng)絡(luò)) 執(zhí)行委員會(huì)委員暨中國(guó)代表
中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)生物大數(shù)據(jù)專業(yè)委員會(huì)委員
中國(guó)人工智能學(xué)會(huì)生物信息學(xué)與人工生命專業(yè)委員會(huì)委員
中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專業(yè)委員會(huì)(籌)委員暨共同發(fā)起人
獲獎(jiǎng)
最受歡迎教師, 2018
北京市教育教學(xué)成果（高等教育）一等獎(jiǎng)(2014-2017, 第一完成人), 2017
北京大學(xué)教學(xué)成果一等獎(jiǎng)(2014-2017, 第一完成人), 2017
首批國(guó)家精品在線開(kāi)放課程(課程負(fù)責(zé)人), 2017
北京大學(xué)教學(xué)優(yōu)秀獎(jiǎng)，2014
入選 首批青年拔尖人才支持計(jì)劃 , 2012
APBioNet Service Award , 2010
首屆綠葉生物醫(yī)藥杰出青年學(xué)者獎(jiǎng) , 2010
擔(dān)任雜志編輯
Editorial board member , Genomics, Proteomics & Bioinformatics , 2012 -
Editorial board member , Hereditas , 2015 -
發(fā)表論文
1. Hu B, Jin J, Guo A, Zhang H, Luo J,Gao G.*. 2014. GSDS 2.0: an upgraded gene feature visualization server.Bioinformatics(doi: 10.1093/bioinformatics/btu817)
2. Xiao A, Cheng Z, Kong L, Zhu Z, Lin S,Gao G.*, Zhang B. 2014. CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool.Bioinformatics30(8): 1180-1182.
3. Jin J, Zhang H, Kong L,Gao G.*, Luo J. 2014. PlantTFDB 3.0: a portal for the functional and evolutionary study of plant transcription factors.Nucleic Acids Res42(1): D1182-1187.
4. Wang J., Kong L.,Gao G., Luo J. 2013. A brief introduction to web-based genome browsers. BriefBioinform14(2): 131-143.
5. Xiao A., Wu, Y., Yang, Z. Hu, Y., Wang, W., Zhang, Y., Kong, L.,Gao, G., Zhu, Z., Lin, S., Zhang B. 2013. EENdb: a database and knowledge base of ZFNs and TALENs for endonuclease engineering.Nucleic Acids Research41(D1): D415-D422.
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7. Wang, J., Kong, L., Zhao, S., Zhang, H., Tang, L., Li, Z., Gu, X., Luo, J., andGao, G.*. 2011. Rice-Map: a new-generation rice genome browser.BMC Genomics12: 165. (Featured as “Highly Accessed”)
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10. Zhao, S.Q., Wang, J., Zhang, L., Li, J.T., Gu, X.,Gao, G.*, and Wei, L. 2009. BOAT: Basic Oligonucleotide Alignment Tool.BMC Genomics10 Suppl 3: S2.
