個人簡介
北京大學生命科學學院生物信息學中心研究員、博士生導師。入選首批青年拔尖人才，亞太生物信息網絡(APBioNet)執(zhí)行理事會委員。
研究內容
隨著以深度測序為代表的高通量生物技術在生命科學領域的廣泛應用，各種生物學大數據以指數增長大量涌現。這些數據之中蘊藏著大量的寶藏，即生物學的新規(guī)律、新發(fā)現。但是，這些海量的、指數增長的、并且高噪聲的生物數據也帶來了巨大的數據分析技術上的挑戰(zhàn)。
課題組以生物信息學分析技術、方法與平臺開發(fā)為基礎，通過綜合運用大數據與統(tǒng)計學習(statistical learning)等計算方法，整合高通量遺傳學與功能基因組學數據，探索新表達調控因子的功能與演化及其對生物體新性狀和新功能的貢獻。
課題組主要研究方向：
1) 非編碼RNA對干細胞命運決定過程的調控
2) 基因組中適應性基因獲得/丟失對調控網絡演化的影響
工作經歷
2011 - , 研究員 , 北京大學生命科學學院
2008 - 2010 , 副研究員 , 北京大學生命科學學院
社會服務工作
APBioNet(Asia Pacific Bioinformatics Network,亞太生物信息學網絡) 執(zhí)行委員會委員暨中國代表
中國遺傳學會生物大數據專業(yè)委員會委員
中國人工智能學會生物信息學與人工生命專業(yè)委員會委員
中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專業(yè)委員會(籌)委員暨共同發(fā)起人
獲獎
最受歡迎教師, 2018
北京市教育教學成果（高等教育）一等獎(2014-2017, 第一完成人), 2017
北京大學教學成果一等獎(2014-2017, 第一完成人), 2017
首批國家精品在線開放課程(課程負責人), 2017
北京大學教學優(yōu)秀獎，2014
入選 首批青年拔尖人才支持計劃 , 2012
APBioNet Service Award , 2010
首屆綠葉生物醫(yī)藥杰出青年學者獎 , 2010
擔任雜志編輯
Editorial board member , Genomics, Proteomics & Bioinformatics , 2012 -
Editorial board member , Hereditas , 2015 -
發(fā)表論文
1. Hu B, Jin J, Guo A, Zhang H, Luo J,Gao G.*. 2014. GSDS 2.0: an upgraded gene feature visualization server.Bioinformatics(doi: 10.1093/bioinformatics/btu817)
2. Xiao A, Cheng Z, Kong L, Zhu Z, Lin S,Gao G.*, Zhang B. 2014. CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool.Bioinformatics30(8): 1180-1182.
3. Jin J, Zhang H, Kong L,Gao G.*, Luo J. 2014. PlantTFDB 3.0: a portal for the functional and evolutionary study of plant transcription factors.Nucleic Acids Res42(1): D1182-1187.
4. Wang J., Kong L.,Gao G., Luo J. 2013. A brief introduction to web-based genome browsers. BriefBioinform14(2): 131-143.
5. Xiao A., Wu, Y., Yang, Z. Hu, Y., Wang, W., Zhang, Y., Kong, L.,Gao, G., Zhu, Z., Lin, S., Zhang B. 2013. EENdb: a database and knowledge base of ZFNs and TALENs for endonuclease engineering.Nucleic Acids Research41(D1): D415-D422.
6. Kong, L., Wang, J., Zhao, S., Gu, X., Luo, J., andGao, G.*2012. ABrowse - a customizable next-generation genome browser framework.BMC Bioinformatics13: 2. (Featured as “Highly Accessed”)
7. Wang, J., Kong, L., Zhao, S., Zhang, H., Tang, L., Li, Z., Gu, X., Luo, J., andGao, G.*. 2011. Rice-Map: a new-generation rice genome browser.BMC Genomics12: 165. (Featured as “Highly Accessed”)
8. Xie, C., Mao, X., Huang, J., Ding, Y., Wu, J., Dong, S., Kong, L.,Gao, G., Li, C.Y., and Wei, L. 2011. KOBAS 2.0: a web server for annotation and identification of enriched pathways and diseases.Nucleic Acids Research39(Web Server issue): W316-322.
9. Zhang, H., Jin, J., Tang, L., Zhao, Y., Gu, X.,Gao, G.*, and Luo, J. 2010. PlantTFDB 2.0: update and improvement of the comprehensive plant transcription factor database.Nucleic Acids Research39(Database issue): D1114-1117.
10. Zhao, S.Q., Wang, J., Zhang, L., Li, J.T., Gu, X.,Gao, G.*, and Wei, L. 2009. BOAT: Basic Oligonucleotide Alignment Tool.BMC Genomics10 Suppl 3: S2.
