武德六年(623年)，欽州總管寧長真進貢合浦大珠，昆明、融州、象州等刺史亦進貢筒布，高祖以“道遠勞人，皆不受。”高州首領馮暄、談殿與越州刺史寧道明深感時局對他們不利，便一起商議舉兵反唐，但因遭到南合州刺史寧純的極力反對，于是他們便與寧純反目。后來，高州首領馮暄、談殿與越州刺史寧道明一起，聯(lián)絡附近各溪峒的少數(shù)民族首領，首先舉兵反唐，并攻打寧純從前親手開拓的姜州。寧純也不示弱，立即從南合州起兵救援，把馮暄等部趕走。在這次以寧、馮兩姻親為主發(fā)起的反唐事件中，寧純不但極力反對，而且當馮暄等攻打他從前開拓的姜州時，還毅然起兵救援。

寧純在當時的寧氏家族中文化水平最高，當然也受儒家思想熏陶較深，他認為“忠君”便是愛國，反叛朝廷則是“大逆不道”、是絕不可行的可恥行為，因而他斷然反對，即使親人反目也在所不顧。由于寧純不肯參加謀反，馮暄等便攻打他從前開拓的姜州，他當然不肯善罷甘休，于是起兵救援。然而．為了上述種種原因，寧純與高州馮氏結下了重重仇怨。

貞觀元年年底，馮暄已死。寧純亦遷任越州刺史，馮暄胞弟馮盎繼續(xù)反叛，并屢次騷擾越州邊境，使寧純防不勝防。后來，唐太宗派遣中庶子張元素到越州坐鎮(zhèn)招撫，才把事態(tài)乎息下來。張元素在越州期間，見寧純“謹厚有禮，教其子弟讀書，蠻俗向化，甚為稱贊。”

貞觀八年，卒于廉州刺史任上。