1993年6月23日，渡部恒三緊跟小澤一郎退出日本自民黨另組新生黨。1994年12月新進黨成立后，渡部恒三任黨代理干事長。1996年10月眾議院選舉后，他又被小澤一郎推舉為眾議院副議長。

1996年11月至2003年11月任眾議院副議長，并按規(guī)定脫離當(dāng)時的新進黨，靠近日本民主黨。

渡部恒三主張日中友好，早在1974年1月他就曾批判“青嵐會”反對締結(jié)日中航空協(xié)定的言論。他任厚生大臣期間，1984年7月在接見中國黑龍江省日本孤兒養(yǎng)父母訪問團時，曾代表日本全體國民對孤兒養(yǎng)父母表示衷心感謝。同年10月，渡部恒三率日本政府代表團訪華，在北京參加中日友好醫(yī)院開院典禮。

1992年渡部恒三作為通商產(chǎn)業(yè)大臣訪華，受到江澤民總書記和李鵬總理會見。在會見時他表示：“對中國改革開放不斷深化和擴大的印象十分深刻”，“日本愿意在能源、環(huán)保、技術(shù)等方面進一步加強同中國的合作”。

他愛好高爾夫球、讀書。其妻渡部二三子，1934年4月11日生，日本大學(xué)牙科學(xué)部畢業(yè)，牙科醫(yī)生。長子渡部恒雄，1963年11月3日生，日本東北大學(xué)牙科畢業(yè)，牙科醫(yī)生。