高崇文生性樸厚寡言，不通文字，但卻聰穎敏慧，才智過(guò)人。少年時(shí)，他曾從平盧軍，熟諳兵事。唐德宗貞元年間，隨神策行營(yíng)節(jié)度使韓全義鎮(zhèn)守長(zhǎng)武城（今陜西長(zhǎng)武），治軍有方，很受將士推崇。貞元五年（789年）夏，吐蕃軍隊(duì)3萬(wàn)人進(jìn)攻寧州，高崇文奉命率兵3千前往解救，兩軍激戰(zhàn)佛堂原，在高崇文機(jī)智果敢的指揮下，唐軍大敗吐蕃軍隊(duì)，殺傷1萬(wàn)多人。從此，他的軍事才能逐漸為人們所知，威名日震。

貞元十四年（798年），軍中暴亂，韓全義畏懼而逃，高崇文卻挺身而出收拾局面，殺死為首鬧事者，穩(wěn)定了軍隊(duì)。他也因功升任長(zhǎng)武城都知兵馬使。上任后，高崇文一面抓籌集糧秣，一面整軍練兵，軍隊(duì)?wèi)?zhàn)斗力大大提高，聲威大振，成了遠(yuǎn)近聞名的一支勁旅。

唐順宗永貞元年（805年）冬，西川節(jié)度副使劉辟據(jù)守成都挑起叛亂，朝廷動(dòng)議討伐。宰臣杜黃裳力薦高崇文率軍前往，認(rèn)為只派他單獨(dú)統(tǒng)兵，便可取勝。當(dāng)時(shí)，大唐能征慣戰(zhàn)的宿將很多，人人都以為自己該當(dāng)此重任。及至第二年春，詔令一出，眾將都十分驚訝。高崇文以神策行營(yíng)節(jié)度使的新職，受命率兵討劉。接到詔命后，他立即帶領(lǐng)經(jīng)過(guò)嚴(yán)格訓(xùn)練，裝備精良的5千將士踏上征程，先擊退進(jìn)攻劍門(mén)的吐蕃軍隊(duì)，又解了梓潼之圍，吐蕃軍邢泄部望風(fēng)而逃，高崇文于是收復(fù)梓州，并任東川節(jié)度使。誅殺了敗軍失守的原節(jié)度使李康，誓師盡復(fù)失地。此時(shí)，劉辟退居成都北部150里左右的鹿頭山。該山扼東川、西川要道，地勢(shì)險(xiǎn)要。劉辟在這里大筑工事，又外連八柵，形成犄角之勢(shì)，以抵御高崇文所率大唐精兵的討伐。唐軍攻城那天，恰逢傾盆大雨，進(jìn)攻受阻。次日，再次發(fā)動(dòng)進(jìn)攻，高崇文令其驍將高霞寓親自擂鼓督戰(zhàn)，士卒奮勇登城。劉辟軍驚恐萬(wàn)狀，于是拼死抵抗，城上亂箭、石頭雨點(diǎn)般落下。高崇文見(jiàn)狀，立即組織敢死士卒拼命攻打，終于突破外圍陣地，燒毀柵欄，前后8次沖擊，連連奏捷，殲城外守?cái)场�劉辟軍�?duì)一片混亂，軍心更加浮動(dòng)。先是追隨劉辟叛亂的綿江柵將領(lǐng)李文悅率3千人歸順，不久，鹿頭將領(lǐng)仇良輔也帶2萬(wàn)人舉城投降。被派來(lái)監(jiān)督仇良輔軍的劉辟的兒子方叔、女婿蘇強(qiáng)等，都被五花大綁押赴京師，同時(shí)被押的降卒隊(duì)伍逶迤10多里路。接著，高崇文又乘勝揮師成都，沿途德陽(yáng)等縣城的叛軍，無(wú)不望風(fēng)而降。劉辟這才真正感到大勢(shì)已去，于是帶貼心護(hù)衛(wèi)和盧文若等人，攜金銀財(cái)寶向西逃往吐蕃。高崇文派高霞寓、酈定進(jìn)日夜兼程，勇猛追趕，終于在羊灌田將其截住。在漫山遍野的喊殺聲中，劉辟投了岷江，被唐軍從激流中捉獲，押赴京師斬首。隨之，高崇文率軍進(jìn)駐成都。他們軍令嚴(yán)肅、軍紀(jì)嚴(yán)明，珍寶無(wú)人私吞，市民安居樂(lè)業(yè)。西蜀從此趨于安定。

累累戰(zhàn)功，使高崇文得到連續(xù)升遷，先是被任為檢校司空兼成都尹，并任劍南西川節(jié)度，以及統(tǒng)押邊境少數(shù)民族的云南安撫等使。后來(lái)被封為南平郡王，食實(shí)封300戶(hù)，刻石記功于鹿頭山下。對(duì)此，高崇文并不看重，反而十分厭倦衙門(mén)里繁瑣的案牘諮稟。他再三上疏皇上，認(rèn)為在富庶的西川不利于發(fā)揮自己的才能，要求到荒涼的塞上戍邊。憲宗元和二年（807年）冬，改任鄰、寧、慶三州節(jié)度觀察等使和京西都統(tǒng)。赴任時(shí)，高崇文因功高而誘發(fā)了貪欲，將蜀都的金銀財(cái)寶、能工巧匠搜羅一空，都帶到任上，為他后來(lái)戍邊打下了基礎(chǔ)，所以，他居邠州（今陜西彬縣）3年，邊備整飭。元和四年，高崇文64歲時(shí)病死邊境任上。消息傳到京都，憲宗輟朝3日志哀，贈(zèng)司徒，謚為威武。