光緒五年（1879年）中舉，光緒九年（1883年）進士，選為庶吉士。曾任清末翰林院編修、國史館協(xié)修、會典館總校、侍講、侍讀、日講起居注官、湖北按察使等職。辛亥革命后，任湖北提法使、袁世凱總統(tǒng)府內(nèi)史、北洋政府總統(tǒng)府秘書等職。

一生為官的馬吉樟，和他的家族一起，歷經(jīng)洋務(wù)運動、太平天國、甲午海戰(zhàn)、戊戌變法、八國聯(lián)軍入侵北京、辛亥革命、清帝退位、袁世凱稱帝、五四運動和中國共產(chǎn)黨誕生。在這樣國際國內(nèi)各種勢力紛繁復(fù)雜、錯綜迷離的政治環(huán)境下，馬吉樟卻要風(fēng)得風(fēng)，要水得水，為各派所認同。這不能不歸因于他的眼光、主張和氣節(jié)。

馬吉樟雖為清末進士，但他思想新，學(xué)問深，有自己的見識。光緒三十一年（1905年），清政府徹底停止了科舉制度，全國各省紛紛興辦新式學(xué)堂。馬吉樟與其妹馬青霞聯(lián)合河南籍顯官袁世凱、張邵予等在北京籌辦“豫學(xué)堂”，馬吉樟任學(xué)堂監(jiān)督（校長）。豫學(xué)堂傳播了許多新觀念，培養(yǎng)了許多仁人志士。1906年馬吉樟曾東渡日本，考察實務(wù)。而她的妹妹馬青霞也正是和他一起的這次日本之行，結(jié)識了孫中山、黃興、魯迅、宋教仁、陳其美、何香凝、康有為、梁啟超、張鐘端，并加入同盟會。1907年，他回國任湖北按察使后，又選送40名湖北學(xué)子赴美留學(xué)。

1911年武昌起義爆發(fā)后，馬吉樟雖被袁世凱從老家請回北京，任總統(tǒng)府內(nèi)史、北洋政府秘書長，但他對清政府和北洋政府的腐敗和列強的肆虐痛心疾首。早在《馬關(guān)條約》簽訂時，他憤言：“李鴻章甲午戰(zhàn)爭誤國，馬關(guān)條約賣國，此賊不殺不足以平民憤；倭寇欺我華夏，列強盡是幫兇。我泱泱大國，可悲可嘆焉……”犀利眼光，愛國之情，聲情畢現(xiàn)。

馬吉樟的政治眼光和氣節(jié)還體現(xiàn)在袁世凱稱帝上。雖然袁世凱視其為親信，但在袁世凱稱帝后，馬吉樟卻當(dāng)即辭官。

馬吉樟“嗜古篤學(xué)，謹於為文”，學(xué)識淵博，工于書法，去職后寓居北京，精研金石，潛心著述。有《益堅壯齋稿》遺世。國子監(jiān)祭酒盛昱在評價馬吉樟的篆書時說：“當(dāng)代篆書，首推積生，因其無派，故超乎眾派。”這也正是對馬吉樟?xí)�法最為�?zhǔn)確的概括和評價。

馬氏故居就是有名的馬氏莊園，位于河南省安陽城區(qū)以西22.5公里的安陽縣蔣村鄉(xiāng)西蔣村，2000年9月公布為河南省級重點文物保護單位；2007年4月，被授予AAAA級旅游景區(qū)。

馬氏莊園始建馬吉樟之父馬丕瑤，前后營造了近五十年之久�，F(xiàn)存建筑保存基本完好，建筑群由北、中、南三區(qū)組成，共北、中、南三區(qū)組成，共分六路。每路前后又均建四個四合院，每條中軸線上各開九道門，俗稱“九門相照”。東一路為馬氏家廟，前后兩個院落；南區(qū)一路亦為一組九門相照的建筑。屋頂多為硬山頂，懸山次之。三區(qū)建筑主要有廳、堂、樓、廊、房、門等形式，共401間；占地面積20000多平方米，建筑面積5000多平方米，比著名的山西“喬家大院”還要大1300多平方米。

走進馬氏莊園，立刻感覺到整個莊園布局嚴謹，主次分明，錯落有致，氣勢宏偉；它既有典型北京四合院寬敞明亮的建筑風(fēng)格。又有晉商大院深邃富麗的建筑藝術(shù)，同時，還體現(xiàn)著中原地區(qū)清代官員府第的藍磚灰瓦、五脊六獸掛走廊的建筑特色。因此，這座保存完好、內(nèi)涵豐厚的莊園，被建筑學(xué)家稱為“中州大地絕無僅有的封建官式建筑標(biāo)本”、“國內(nèi)為數(shù)不多的典型的清代官僚府第”。