同年夏回國，應學考試，中法政科舉人，次年廷試列二等，授七品京官，任田賦司行走。辛亥革命后，歷任北洋政府農(nóng)林部僉事、水產(chǎn)司第一科科長、農(nóng)商部主事、僉事、漁牧司科員、編輯處幫辦、實業(yè)部僉事、編輯處處長。曾兼任北京各大學講師。后歷任南京政府工商部一等科員、監(jiān)察院檔件室主任、文書科科長。1948年退休，閉戶專研經(jīng)史。

1951年12月被聘任為中央文史研究館館員。1974年11月29日逝世，終年96歲。

漆運鈞精讀古籍，著有《四書集字說文鈔》、《十三經(jīng)集字》、《春秋左氏傳人表》和多種讀書札記以及清史研究筆記。譯有《日本史要》、《日本地理要論》等。此外，他還為文字改革工作作出了自己的貢獻。