畢業(yè)后，入劉公島北洋水師槍炮學(xué)堂實(shí)習(xí)。不久，到“濟(jì)遠(yuǎn)”艦當(dāng)艦員。光緒二十年(1894年)六月下旬，“濟(jì)遠(yuǎn)”艦護(hù)運(yùn)赴牙山，歸途遇日艦，與之激戰(zhàn)�！皾�(jì)遠(yuǎn)”中炮，傷亡慘重，鐘瑛協(xié)助管帶方伯謙指揮戰(zhàn)斗，接連發(fā)炮重創(chuàng)日旗艦“吉野”號(hào)。后隨艦參加黃海海戰(zhàn)與威海衛(wèi)保衛(wèi)戰(zhàn)。光緒二十五年(1899年)，調(diào)任“飛鷹”艦、“福靖”艦槍炮員。從光緒二十八年(1902年)起，歷任“海琛”、“海天”、“�；I”各艦船械、駕駛、幫帶。光緒三十年(1904年)，升為“飛鷹”艦管帶。光緒三十三年(1907年)，任“鏡清”艦管帶兼海軍部參謀，不久，調(diào)任“海籌”艦管帶。宣統(tǒng)三年(1911年)武昌起義后，清軍大舉南下，進(jìn)攻湖北革命軍；清海軍統(tǒng)領(lǐng)薩鎮(zhèn)冰率長(zhǎng)江艦隊(duì)進(jìn)駐武漢江面，見(jiàn)軍心同情革命，以治病為名，棄艦赴滬，由鐘瑛擔(dān)任臨時(shí)艦隊(duì)司令，率艦隊(duì)駛至九江，經(jīng)林森等人動(dòng)員，鐘瑛率艦隊(duì)起義，與九江陸軍義軍組織陸海軍聯(lián)合委員會(huì)。十一月，漢口、漢陽(yáng)相繼失守，黃鐘瑛率艦救援武昌。不久，停戰(zhàn)議起，各艦代表在上海選舉程璧光為總司令，鐘瑛為副司令。因璧光在英國(guó)未回，鐘瑛任代總司令。民國(guó)元年(1912年)，臨時(shí)大總統(tǒng)孫中山任命鐘瑛為海軍總長(zhǎng)兼海軍總司令。鐘瑛決心整頓海軍，成立隨營(yíng)宣講團(tuán)，編輯出版《軍中白話宣講書(shū)》。南北和議后，北洋政府任命劉冠雄為海軍總長(zhǎng)，鐘瑛仍任海軍總司令。鐘瑛提出辭職，于4月11日免職。同年12月4日病逝。孫中山撰聯(lián)挽之。