葡萄牙國王阿方索二世的長子，母親為卡斯蒂利亞公主烏拉卡。1223年，阿方索二世駕崩，桑喬二世以14歲之齡繼承了王位。其父阿方索二世執(zhí)政時(shí)因企圖削弱教會權(quán)力，而被教皇洪諾留三世處以絕罰。桑喬二世登位后，大權(quán)由幾位攝政大臣掌握，地方貴族擁兵自重，內(nèi)戰(zhàn)紛爭不斷。1229年，桑喬二世親政后因?yàn)榻袒实奶厥沟搅似咸蜒�，想幫助王國平息�?nèi)戰(zhàn)和恢復(fù)社會秩序，而召開了第一次宮廷會議。桑喬二世是天生的征服者，他率軍南征摩爾人的土地，將葡萄牙的邊境線延伸到了海邊的阿爾加維地區(qū)。但是，桑喬二世雖然征服了許多地區(qū)，但是正因他窮兵黷武失去民眾的支持，內(nèi)戰(zhàn)仍然不斷，中產(chǎn)階級與教會人士不斷爭執(zhí)。

這時(shí)里斯本主教上書告到了羅馬教廷，要求教皇英諾森四世廢黜桑喬二世。1245年，教皇正式宣布廢除桑喬二世的葡萄牙國王的頭銜，由其弟弟法國的博羅尼亞伯爵阿方索繼位。阿方索保證尊重教會的賦稅豁免權(quán)，然后就從法國趕回里斯本。桑喬二世與阿方索打了兩年內(nèi)戰(zhàn)。無奈桑喬二世不得民心而戰(zhàn)敗，被逼逃到了卡斯蒂利亞的托萊多。1248年在當(dāng)?shù)厥攀溃�并被葬在�?dāng)?shù)�。阿方索繼位為葡萄牙國王，是為阿方索三世。1240年左右，桑喬與門西亞·洛佩斯·德·阿羅結(jié)婚。門西亞·洛佩斯的父親是比斯開領(lǐng)主洛佩·迪亞斯二世·德·阿羅，母親是萊昂國王阿方索九世的私生女。桑喬與門西亞·洛佩斯沒有子女。