嘉靖十三年(1534年)中式舉人，授山東濟南府通判。林一陽到任，立即革除不合理的糧例，每年數(shù)以萬計。遇荒年，賑濟得法，百姓流離轉(zhuǎn)徙者，錢米不能繳交，一陽代為借公款，設(shè)法召糧商，按平價折算，替其繳交錢糧，公私都方便。后來，因為漕運超過限期，被貶為南京鳳陽府壽州霍丘知縣�；羟鹂h有冠帶的官吏多至四五百人，這些人挾制知縣，分庭抗禮，上兩任知縣都被這些人弄得身敗名裂。林一陽赴任后，整頓秩序，凡要進縣堂者，必須列隊按班次，由差役嚴(yán)肅恭敬地引進。這樣，那些冠帶者受到威懾，都不敢違抗，因而政行令施�？h內(nèi)士子沒有明師指教，一陽親自為士子指授訓(xùn)釋。縣多盜賊和私鑄錢幣等不法行為，一陽用守法樂業(yè)的道理來教育百姓，民俗起了明顯的變化。徭役負擔(dān)都登記在冊，以前的縣令接受賄賂，服役與底冊不相應(yīng)，百姓多因此而破產(chǎn)，一陽深知此弊，改變以前不合理的做法，按冊籍情況負擔(dān)徭役，解脫百姓的困境。他嚴(yán)格執(zhí)行保甲法，訂正鄉(xiāng)飲酒禮，整治私秤，積聚公有秣草等，宿弊盡革，百廢俱興。百姓感恩載德，為林一陽立生祠祀之，在其離任后，立碑思念。

隆慶元年(1567年)升唐府審理，為人正直不合于時，上疏乞請歸休。林一陽為政寬猛得宜，人懷其德，猶畏其威。他對理學(xué)有精深的研究，尊崇宋朝程、朱理學(xué)，認為：“道德到二程，有何不盡，何須別立教門”。以居敬窮理為宗旨，對王陽明的學(xué)說進行批判和抵制。林一陽與堂侄林楚(春齋)是嘉靖、萬歷間漳州府的兩位理學(xué)名家，為漳浦縣理學(xué)鄉(xiāng)賢。林一陽擅長書法，人稱其“有晦庵(朱熹)、白沙(陳獻章)筆意”。林一陽文章道德為世楷模。隆慶間，漳浦縣丞丘魯重修威惠廟，請林一陽撰寫《重修威惠廟碑記》。林一陽的胞兄林一初，舉人；胞弟林一新進士，官云南按察司僉事，世稱“三鳳齊鳴”，其府第稱為三鳳廳，并沿用為自然村名稱，又合堂弟林策，進士；林成綱，舉人，官香山知縣，稱為“五桂聯(lián)芳”。萬歷六年(1578年) 林一陽卒于家，終年71歲。

《論學(xué)古義》、《詩文集》若干卷。