新中國成立后，吳泮洲在法庫縣人民醫(yī)院任醫(yī)師。1950年12月新婚僅6天的吳泮洲，毅然參加抗美援朝戰(zhàn)勤支隊法庫團部工作，任戰(zhàn)勤醫(yī)生�？姑涝�朝戰(zhàn)勤支隊赴朝后，吳泮洲全力開展戰(zhàn)區(qū)的衛(wèi)生醫(yī)療工作，確保了分擔的區(qū)域內沒有發(fā)生任何疫情，配合了前方戰(zhàn)事的勝利發(fā)展。還主動擔當日語翻譯，為戰(zhàn)勤服務。在抗美援朝戰(zhàn)爭中，戰(zhàn)勤部隊時常遭遇美軍空襲。1951年底，吳泮洲所在的法庫戰(zhàn)勤支隊完成任務回國。

1952年，吳泮洲復員后，任法庫縣人民醫(yī)院副院長(主持工作)。

吳泮洲在任副院長期間，首先為醫(yī)院建立起一套完整的會診、院領導定期檢查病房、特殊患者專醫(yī)專護和死亡病案討論等制度；接著又建立起縣城、鄉(xiāng)鎮(zhèn)、村三級醫(yī)療服務網絡。在法庫籌建了戰(zhàn)備醫(yī)院。吳泮洲自學中醫(yī)中藥，率先開展中西醫(yī)相結合的治療方法。20世紀50年代末，法庫曾發(fā)生一起多人接觸“廢油”中毒事件，接觸“廢油”者，除有中毒癥狀外，還出現精神失常癥狀。針對上述病狀，吳泮洲迅速地提出了中西醫(yī)相結合的醫(yī)療方案，組織醫(yī)護人員對中毒者進行緊急搶救，挽救了全部中毒者的生命。吳泮洲在法庫創(chuàng)辦了中西醫(yī)函授大專班、中專班，親自授課，培養(yǎng)了一大批中醫(yī)中藥人才。1961年，國家批準吳泮洲享受高級知識分子待遇。吳泮洲在醫(yī)療實踐中，表現了無私忘我的精神。1964年，全縣大面積發(fā)生麻疹疫情，吳泮洲顧不得正在發(fā)病的兩個兒子，帶領醫(yī)護人員奔赴重災區(qū)紅旗公社(今孟家鄉(xiāng))組織搶救，實行危重病人集中搶救、中輕度病人對癥治療，迅速控制了疫情，消除了病源體。在計劃生育工作中，為開展“男扎手術”，吳泮洲以身示范，帶頭做了“男扎手術”。1964年除夕，一名顏姓患者得了中毒性痢疾，已昏迷24小時。患者入院后，吳泮洲親自看護患者一天一夜，經過爭分奪秒的搶救，使患者轉危為安。在“文化大革命”期間，吳泮洲被帶上“資產階級反動學術派”等四頂“帽子”，白天被批判游斗，晚上仍為患者治病，經常是午夜回家，并對家人說：“我們要相信群眾，我們要相信黨”。

20世紀70年代初，吳在發(fā)現自己的肛腸病加重的情況下，仍參加了省里舉辦的國際先進醫(yī)療經驗學習班�；卦汉笱杆匍_展推廣工作，把為自己治療的時間拖后了半年之久，致使肛腸病發(fā)生病變。

吳泮洲擔任縣醫(yī)院副院長期間，一貫嚴于律己，廉潔奉公。無論是上下班、開會、下鄉(xiāng)出診，交通工具是自己的自行車。在醫(yī)療過程中，從未收過患者的“紅包”。

1973年至1983年，吳泮洲曾先后擔任法庫縣革委會委員、縣衛(wèi)生局副局長、中華醫(yī)學會法庫分會會長，第八屆、第九屆縣人大代表，政協法庫縣第四屆委員會副主席。

1983年5月，吳泮洲病逝于法庫，終年62歲。法庫人民在長逸公墓為吳泮洲立了墓碑，在碑上刻有題為《醫(yī)魂》的詞：“康復萬戶舒，天使德無境。智技同付出，百苦敢釋夢。妙手欲回春，千古醫(yī)魂頌。赤血若扶幾脈流，拳報關天命�！痹撛~道出了法庫人民的心聲。