回國(guó)后，清政府授予進(jìn)士，參加殿試，被點(diǎn)為翰林院編修，供職于新軍編練部門(mén)。宣統(tǒng)二年(1910年)，江蘇巡撫程德全在蘇州開(kāi)辦公立醫(yī)士學(xué)堂，奏調(diào)劉慶綬回省任醫(yī)學(xué)堂教員。不久，至南京留守府工作。先后在天津、北京軍醫(yī)學(xué)校任教授。其間曾派至美國(guó)哈佛大學(xué)研究院進(jìn)修泌尿科及當(dāng)時(shí)新興之愛(ài)克斯光科3年。民國(guó)11年(1922年)回國(guó)，仍在北京陸軍軍醫(yī)學(xué)校任教，兼任北洋政府中央防疫處技正。時(shí)東三省又暴發(fā)較多鼠疫病例，主管部門(mén)派劉慶綬組隊(duì)前往防治，使疫勢(shì)得到遏止。民國(guó)13年（1924），鎮(zhèn)江各界集資籌建私立弘仁醫(yī)院。他應(yīng)聘回鎮(zhèn)主持弘仁醫(yī)院建設(shè)并就任第一任院長(zhǎng)。兩年后，在南京行醫(yī)，兼在國(guó)民政府交通部任職。