父親曾存仁，任云南布政使。嘉靖三十八年（1559）進士，授官刑部主事，后改禮部，又遷任吏部文選主事。依照慣例，丞簿以下官職，聽取小官吏們的衡量審核，曾同亨都是親自辦理，與陸光祖、李世達齊名。隆慶初年，任文選郎中，后進為太常少卿，請求馬上辭去。萬歷初年，起用任大理少卿。歷順天府尹，以右副都御史之職巡撫貴州。張居正死，起用任南京太常卿。被召回任大理卿，升遷工作部右侍郎。督治壽宮時節(jié)約費用三十多萬，同亨初次進入吏部，和嚴嵩是同鄉(xiāng)，尚書吳鵬則是父親同年，同亨從沒有私自拜訪。曾經(jīng)住宿在官署宿舍中，一月都不回去。去世時年七十五歲。追贈少保，謚號為“恭端”。

曾同亨，字于野，吉水人。父存仁，云南布政使。同亨舉嘉靖三十八年進士。授刑部主事。改禮部，遷吏部文選主事。故事，丞簿以下官，聽胥吏銓注，同亨悉躬親之。與陸光祖、李世達齊名。隆慶初，為文選郎中，薦用遺佚幾盡。進太常少卿，請急去。萬歷初，起大理少卿。歷順天府尹，以右副都御史巡撫貴州。御史劉臺得罪張居正，同亨，臺姊夫也，給事中陳三謨欲并逐之，奏同亨羸不任職。詔調(diào)南京，遂移疾歸。九年，京察拾遺，給事中奏燿、御史錢岱等復希居正指，列同亨名。勒休致。

居正卒，起南京太常卿。召為大理卿，遷工部右侍郎。督治壽宮，節(jié)浮費三十余萬。由左侍郎進尚書。軍器自外輸，率不中程，奏請半收其直，又請減織造之半。皆報可。汝安王妃乞橋稅，同亨拒之。帝竟如妃請。內(nèi)府工匠，隆慶初數(shù)至萬五千八百人，尋汰二千五百人，而中官濫增不已。同亨疏請清厘。已得旨，中官復奏寢之。給事中楊其休疏爭，弗納。同亨弟乾亨請裁冗員以裕經(jīng)費，京衛(wèi)諸武臣謂減己月俸也，大嘩，伺同亨出朝，圍而噪之。同亨再乞休，不得請。九門工成，加太子少保。力乞去，詔乘傳歸。起南京吏部尚書，辭不拜。久之，再起故官，累辭乃就職。稅使所在虐民，同亨極諫。三十三年，大計京官，與考功郎徐必達持正不撓。是年，北察失執(zhí)政意，中旨留給事中錢夢皋等；南察及同亨自陳疏，亦久不下。同亨適給由入都，遂引疾。詔加太子太保致仕。

同亨初入吏部，嚴嵩其鄉(xiāng)人，尚書吳鵬則父同年也，同亨無私謁。嘗止宿署舍，彌月不歸。雅與羅汝芳、耿定向善。尚書楊博痛詆偽儒，同亨曰：「此中多暗修，非可概斥。即使陽假名義，視呈身進取、恬不知恥者，孰愈哉？」卒年七十有五。贈少保，謚恭端。