在仁壽三年（853年），藤原明子為女御，賜從三位。天安二年(858年)敘從一位。其子清和天皇即位后，尊為皇太夫人，貞觀六年（864年）晉皇太后。貞觀八年（866年），遷居甫落成之常寧殿。貞觀十年（868年）冬，皇太后藤原明子四十歲，遣敕使前往京城、平城等地區(qū)各四十間寺院布施功德，又在常寧殿賜宴皇族公卿、于朱雀門外布施貧民。貞觀十四年（872年），遷居染殿宮，從此世稱染殿后（そめどのの きさき）。貞觀十六年（874年）春，遷居職院。元慶二年（878年）冬，藤原明子五十歲，清和上皇遣五十名僧侶于清和院開講法華經(jīng)。元慶六年（882年）正月，陽(yáng)成天皇尊藤原明子為太皇太后。仁和元年（885年）二月，太皇太后藤原明子向光孝天皇請(qǐng)減女官，但不為光孝天皇所從。昌泰三年（900年）五月，太皇太后藤原明子逝世，享年七十二歲，葬于愛(ài)宕郡白河山陵。藤原明子一生歷經(jīng)文德天皇、清和天皇、陽(yáng)成天皇、光孝天皇、宇多天皇、醍醐天皇等六代天皇治世，最后以72歲的年齡逝世，在當(dāng)時(shí)算是相當(dāng)長(zhǎng)壽。