1924年，孫紹宗畢業(yè)后，在石家莊籌建紗廠。1928年，任陜西省水利局局長的李儀祉得悉孫紹宗的情況后，立即邀請他到陜西省水利局工作，他欣然答應，出任省水利局總工程師。在水利局工作期間，孫紹宗長途跋涉，觀察路線，精心設計涇惠渠、浴惠渠、渭惠渠、梅惠渠、織女渠等水刊工程。修建涇惠渠時，他把全家人安置在涇陽縣的北趙莊，自己食宿在工地，時值陜西三年大旱之后，群眾困苦不堪，除完成勘察設計施工外，他還協(xié)助李儀祉籌款。

1938年3月8日，李儀祉逝世，孫紹宗任陜西省水利局局長，完成了渭惠渠、織女渠等水利工程，又主持了黑惠渠、灃惠渠、澇惠渠等水利工程，繼而又在陜南修建了漢惠、褒惠、清惠、洛惠等渠。為當時農業(yè)生產發(fā)展作出了巨大貢獻。

1939年初，孫紹宗任陜西省政府委員兼建設廳廳長（1939.1—1941.7），其間仍兼陜西省水利局局長，在此期間除完成一些水利工程外，主持修建了長（安）坪（西坪）公路，打通了秦嶺山區(qū)通往河南南陽和湖北武漢的重要通道，結束了自古以來兩地區(qū)相互阻隔的局面。

1940年7月，國民政府為組織人、畜運力進行戰(zhàn)時物資運輸，決定在交通部設驛運總管理處，各省設立驛運處， 同年10月，陜西省驛運管理處成立，歸省建設廳領導，廳長孫紹宗兼任處長。

1945年日本帝國主義投降后，孫紹宗看到國民黨當局腐敗，憤然辭去省水利局長職務，仍從事水利工程的設計和施工。并在西安辦紡織工業(yè)。1948年，孫紹宗攜家去臺灣，仍辦工業(yè)及水利設計施工工作。

1957年，孫因病去世，1986年由其子將骨灰運回祖國，安葬在北京萬安公墓。