歷任湖北省政府辦公廳經(jīng)濟(jì)處主任科員、計(jì)財(cái)處副處長(zhǎng)、計(jì)劃財(cái)貿(mào)處處長(zhǎng)、計(jì)劃財(cái)稅處處長(zhǎng)、人事處處長(zhǎng)；

湖北省清江水電投資公司黨組成員、副總經(jīng)理等職務(wù)；

2005年2月至2008年6月，擔(dān)任湖北省能源集團(tuán)有限公司黨委書(shū)記、副總經(jīng)理；

2008年6月至今，擔(dān)任湖北能源集團(tuán)股份有限公司副董事長(zhǎng)、黨委副書(shū)記。（正職級(jí)）

兼任湖北宣恩洞坪水電有限責(zé)任公司董事長(zhǎng)。

2016年12月27日，政協(xié)湖北省第十一屆委員會(huì)第十七次常委會(huì)議通過(guò)，由于達(dá)到退休年齡、工作變動(dòng)原因，決定：巫軍同志不再擔(dān)任省政協(xié)常務(wù)委員、提案委員會(huì)副主任、委員職務(wù)。