簡(jiǎn)介
1991年獲中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)士;1996年獲Albert Einstein College of Medicine 博士;1997-1998年,為T(mén)he Rockefeller University 博士后;1999-2002年,為IT軟件工程師;2002-2004年,為Dana Farber Cancer Institute and Harvard Medical School博士后。2004年中國(guó)科學(xué)院"百人計(jì)劃"入選者,2005年獲得國(guó)家杰出青年科學(xué)基金。
研究方向
1. 研究生物網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu), 動(dòng)態(tài)及其功能。遺傳基因的網(wǎng)絡(luò)由網(wǎng)點(diǎn)(node) 和連接網(wǎng)點(diǎn)的網(wǎng)線(xiàn)(edge)組成。網(wǎng)點(diǎn)包括蛋白質(zhì), 基因調(diào)節(jié)的元素和基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物;而網(wǎng)線(xiàn)是指實(shí)際的或遺傳基因的相互作用。經(jīng)過(guò)復(fù)雜的相互作用和邏輯操作,這些網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)地形成復(fù)雜的、合乎邏輯的線(xiàn)路, 進(jìn)一步形成整體結(jié)構(gòu),從而執(zhí)行細(xì)胞的各種功能!2. 利用functional genomics的數(shù)據(jù),尋找疾病有關(guān)的基因及進(jìn)一步研究其病理作用。最近已經(jīng)產(chǎn)生了大量模型生物的 proteomics 和整體生物學(xué)數(shù)據(jù),例如,酵母菌、線(xiàn)蟲(chóng)、果蠅的interactome、phenome、transcriptome,而且這些數(shù)據(jù)還在不斷地向深度與廣度方面延伸。同時(shí),新類(lèi)型的 proteomic 整體實(shí)驗(yàn)也不斷加入,如promoterome、亞細(xì)胞定位、組織定位等。另一方面,這些方法已經(jīng)開(kāi)始應(yīng)用于人類(lèi)。對(duì)如何整合和挖掘這些大量原始數(shù)據(jù)提出了迫切要求。 3. 探求遺傳基因網(wǎng)絡(luò)中內(nèi)在的安全穩(wěn)定機(jī)制。生物對(duì)單個(gè)遺傳基因的干擾(perturbations)相當(dāng)不敏感, 在大多數(shù)的情況下單一基因丟失并不造成生物的死亡。遺傳基因通路的結(jié)構(gòu)在基因敲除(knock-out)的情況下可能與正常狀態(tài)下是不同的, 這意味著網(wǎng)絡(luò)有可塑性(plasticity)!≡撗芯拷M將利用data mining 的工具及網(wǎng)絡(luò)理論建立計(jì)算模型與提出工作假設(shè),而后用整體生物學(xué)的手段證實(shí)與改進(jìn)模型和假設(shè)。