因家境貧寒，巫復生只讀三年私塾。1932年10月，中央紅軍第二十二軍第六十四師進駐邵武屯上、劉家邊、溪頭等地。在紅軍言行舉止及革命活動影響下，16歲的巫復生毅然決定參加紅軍，投身革命。巫復生加入紅軍后，先后在紅二十二軍第六十四師政治部任勤務員，在特務連做過文書。1933年，部隊開赴江西后，編為紅一方面軍一軍團二師，巫復生任教導隊三排（青年干事訓練排）排長。1934年10月，隨部隊到江西興國開始二萬五千里長征。1935年10月，部隊到達陜北后，巫復生任紅一軍團政治部宣傳隊副隊長。1936年，任紅一軍團政治部指導員。1937年“七七”盧溝橋事變后，任八路軍一一五師電臺指導員、一一五師政治部指導員。1938年，任一一五師教導員、一一五師教導大隊黨總支書記、師司令部指導員。1944年調(diào)任魯南軍區(qū)政治部組織科長。1945年，調(diào)任十五團，先后任特務團政委、師部政委。

新中國成立后，巫復生曾任南京下關(guān)海軍學校政委、大連海軍工程學院副政委、南京海軍學院副政委、南京海軍學院顧問等職。1988年7月被授予二級紅星功勛榮譽章。1993年9月8日，因病在南京逝世。