祖籍浙江余姚（今寧波余姚市）咸山。父親為臺(tái)灣著名報(bào)人中央日?qǐng)?bào)社前社長阮毅成，是家中第五子。母錢英，出自杭州錢氏名門，是五代吳越國王錢镠之后，曾任中華民國首屆臺(tái)灣地區(qū)民意代表，著名“立法院十姐妹”之一。祖父阮性存，是杭州大律師。兄阮大正、阮大方均為臺(tái)灣著名報(bào)人、評(píng)論家。
早年學(xué)習(xí)數(shù)學(xué)，1965年，畢業(yè)于國立臺(tái)灣大學(xué)數(shù)學(xué)系。1966年，赴美國留學(xué)。獲得美國圣母大學(xué)數(shù)學(xué)博士學(xué)位。后轉(zhuǎn)行入企業(yè)管理，獲得威斯康星大學(xué)麥迪遜分校企業(yè)管理碩士學(xué)位。再入斯坦福大學(xué)，獲得計(jì)算機(jī)工程碩士學(xué)位。

阮大仁曾在各行業(yè)活躍，曾任大學(xué)數(shù)學(xué)教授，美國高科技企業(yè)電腦工程師、項(xiàng)目主管和負(fù)責(zé)研發(fā)，還在銀行業(yè)做過主管。而評(píng)論時(shí)政和研究歷史最初只是他個(gè)人閑暇愛好，因研究“正史”、兼通“野史”，自號(hào)“二史堂主人”。阮大仁也頗擅書法。
阮大仁退休之后，著有《蔣中正日記揭密》，是有較大影響的歷史著作，因其父早年為蔣中正侍從秘書，該書內(nèi)有很多歷史機(jī)密，包括外蒙古獨(dú)立、稱為聯(lián)合國成員國的一些內(nèi)幕。
曾將珍藏多年的父親書信捐贈(zèng)給浙江大學(xué)。其父阮毅成是浙大法學(xué)院首任院長。