這時(shí)太監(jiān)瞿密等勾結(jié)外藩弄權(quán)受賄，方子深3次上疏，請(qǐng)求加以制裁，沒(méi)有批復(fù)。遂又列舉漢、唐兩代的 曹節(jié)、 楊復(fù)恭竊權(quán)誤國(guó)的故事作比，太祖感悟，對(duì)瞿密等作了處分。有人為他擔(dān)憂(yōu)，方子深道：“做臣子的應(yīng)死于忠，做兒子的應(yīng)死于孝。害怕自己送命而討好權(quán)奸，希求富貴，這是商賈謀利的行為，我難道也這樣做?”由于權(quán)奸勢(shì)力盤(pán)根錯(cuò)節(jié)，方子深被借故彈劾，下獄，處死。寧海 方孝孺寫(xiě)了《果庵傳》為之昭雪，其中說(shuō)：“國(guó)初俊彥群興，惟先生不避刀鋸，屹然敢言，抑奸排偽，不少姑息。試方之東漢 三君(按：指漢末 黨錮之禍中犧牲的 竇武、 陳蕃、 劉淑)，殆相上下不遠(yuǎn)矣�！边z著有《葺巢集》，在變故中散失。