十四年四月，疏發(fā)河南管河道方大猷貪惏狀，上切責(zé)河道總督楊方興失劾，奪大猷官，鞫治論死。有高鼎者，據(jù)五臺山為亂，出三岔口擾真定，廕祖遣井陘道陳安國諭降，悉散其黨。疏言：“太行天下險(xiǎn)，三岔居其沖，林密山深，藏奸甚易。自鼎降，其黨散在民間，雖戍以兵，視營壘為傳舍。當(dāng)置游擊一，定額兵六百，專司守御。”上從之。

是歲廕祖年才二十有九，會湖南北用兵，上察廕祖才，加太子太保，移督湖廣。師方徇貴州，故李自成諸將郝永忠、袁宗第、劉體純、李來亨輩挾十馀萬人降於明，踞鄖、襄間，擾餉道。廕祖請選襄陽水師及均、黃、漢陽諸營兵二千人戍谷城，地扼上游；選武昌洞庭營兵千人戍九溪，斷通蜀道。十五年，漢陽、天門、潛江、沔陽諸郡縣水災(zāi)，上命廕祖治賑，民賴以得拯。

十六年，經(jīng)略大學(xué)士洪承疇疏請發(fā)湖北提鎮(zhèn)標(biāo)兵六千人戍云南，廕祖以承疇已發(fā)湖廣兵萬三千五百有奇，湖南新收降人數(shù)萬，鄖、襄間流賊未殄，留兵不宜復(fù)發(fā)，請敕承疇就滇中召募，下部議行。復(fù)疏議：“討永忠等，請敕四川總督李國英帥師駐重慶，扼巫峽，阻達(dá)州；西安將軍富喀禪帥師趨興安；河南協(xié)剿兵詣襄陽合軍。臣督諸軍分出彝陵、襄陽、鄖陽，三道深入，期一舉滅賊�！笔杓壬�，會鄭成功犯江南，詔將軍明安達(dá)哩將荊州駐防兵赴援，部議緩師期。十七年，以疾乞罷。康熙三年，卒。祀直隸、山東、河南、湖廣名宦。