張鵬翼幼年雖處于戰(zhàn)亂、饑饉相繼，人民顛沛流離，社會(huì)十分動(dòng)亂的情況下，也從不荒廢學(xué)業(yè)，仍積極奮發(fā)上進(jìn)。當(dāng)清廷統(tǒng)治福建后，統(tǒng)治者為了政治安定，經(jīng)濟(jì)發(fā)展，必須收買民心，籠絡(luò)知識(shí)分子，便采取了開科取士的措施。知識(shí)分子在新王朝的統(tǒng)治下，企圖通過金榜掛名，進(jìn)入仕宦統(tǒng)治階層。故張鵬翼“亦刻意場(chǎng)屋之學(xué)”，希望仕途暢達(dá)，科舉揚(yáng)名，而勤奮苦讀于囊螢映雪之中。但他的治學(xué)目的，曾明確表示要繼承朱熹“學(xué)以致用”的思想，他說：“讀書當(dāng)思實(shí)踐，毋徒事文藝”，這樣一來(lái)，他參加科舉考試自然就難得勝而歸了。盡管“屢試不第，而好學(xué)之心不倦。”

康熙十三年（1674）三藩叛亂，耿精忠給福建人民帶來(lái)莫大災(zāi)難。這時(shí)已經(jīng)四十歲的張鵬翼無(wú)意于仕途進(jìn)取，于是“棄舉業(yè)，乃返初志”，“終日端坐，跬步不茍”，埋頭鉆研古籍，“銳志問學(xué)，虛心集益”，開始認(rèn)真研究《近思錄》及《朱子全集》。后十年（五十歲）始學(xué)習(xí)薛文清的《讀書錄》，但因連城新泉僻處萬(wàn)山叢中，無(wú)師友可為共同磋商探討或請(qǐng)教，只好獨(dú)坐蕓窗，反復(fù)琢磨，刻意求工，探求真諦。終于在學(xué)術(shù)研究上取得了突破，由是聲名漸播，而成為一代理學(xué)巨子。同代人當(dāng)湖陸清獻(xiàn)與張鵬翼性格相近，皆尊崇程、朱理學(xué)為儒學(xué)正宗，學(xué)術(shù)上文字往來(lái)，交誼甚密。后來(lái)，漳浦蔡文勤聞其名，曾手書“醇學(xué)”二字，表彰其鄉(xiāng)里家族。

張鵬翼一生著作很多，刊刻行世的有《理學(xué)入門》、《將相諫三譜》（又名《立朝三譜》）、《史案》、《中華世統(tǒng)圖說》、《芝壇雜說》、《四書五經(jīng)說略》、《日讀小記》、《圣道元亨頌》、《負(fù)歲錄》、《桑梓錄》、《警世格言》、《芝壇文集》等。

康熙五十四年，一生辛勤治學(xué)的張鵬翼，在取得豐碩成果后離開了人世，享年八十三歲。