靜岡縣出身。醫(yī)生多門信夫的第二子。高小畢業(yè)，陸軍幼年學(xué)校，1899年11月陸軍軍官學(xué)校11期畢業(yè)，翌年6月，步兵少尉任官，步兵第4聯(lián)隊付。歷任仙臺陸軍地方幼年學(xué)校學(xué)監(jiān)等，日俄戰(zhàn)爭時期的步兵第4聯(lián)隊小隊長。戰(zhàn)后歷任步兵第4聯(lián)隊副官，步兵第3旅副官等，1909年12月，陸軍大學(xué)21期畢業(yè)。后任陸士教官，第6師參謀，步兵第62聯(lián)隊大隊長，陸大教官，歐洲出差，步兵第27聯(lián)隊付，1920年2月16日，經(jīng)大正天皇批準(zhǔn)，編成以多門二郎大佐指揮的步兵大隊為基干的尼港（尼古拉耶夫斯克）派遣隊，但因結(jié)冰期等原因，暫留在北海道待命。4月中旬，盛傳日俄軍隊發(fā)生沖突，多門支隊啟程到亞歷山大羅夫斯克，6月進入尼港。后任濱海州派遣軍參謀，步兵第2聯(lián)隊長，第四師團參謀長，1924年2月晉升陸軍少將。歷任步兵第6旅長，陸大付校長，參謀本部第4部長，陸大干事等，1929年8月，成為陸軍中將陸大校長。以后作為 第二師團長駐防滿洲，當(dāng)時的 關(guān)東軍也就只有第二師團這一萬多人的護路兵， 滿洲事變爆發(fā)后率軍驅(qū)逐20萬東北軍，占領(lǐng)東三省。（遼寧的東北軍根據(jù) 張學(xué)良的不抵抗命令根本就是不戰(zhàn)而撤，主持吉林軍務(wù)的 熙洽是他學(xué)生，不戰(zhàn)而降，黑龍江的 馬占山舉行了 江橋抗戰(zhàn)，但最終被 土肥原賢二勸降），他主要是對付蜂起的義勇軍，但成效不大。1933年1月回國，同年8月被編入預(yù)備役。 第二年死去。姐夫 松川敏胤陸軍大將。

1930年春，日本軍部特意將耐寒作戰(zhàn)的 第二師團從日本北海道調(diào)來中國東北，司令部設(shè)在遼陽，師團長就是多門二郎中將。1931年日本發(fā)動九一八侵華戰(zhàn)爭，根據(jù) 關(guān)東軍司令官 本莊繁的決定，關(guān)東軍參謀部發(fā)出命令：駐遼陽的多門 第二師團全力向沈陽集中，攻擊該地的中國軍隊。

多門師團主力第十五旅團抵達沈陽后，立即參加攻占沈陽的戰(zhàn)斗。19日上午8時，第十五旅團占領(lǐng)了航空處及兵工廠。其后， 板垣征四郎和多門二郎共同指揮了對東大營的攻擊，12時30分許，日軍占領(lǐng)了東大營。這天（9月19日），多門二郎還以 第二師團師團長名義發(fā)出布告，稱：“茍有危害日僑生命財產(chǎn)者，不問何人，定以槍決從事。”并宣布一律禁止“示威運動集會，惑圖滋擾之行為”，違者“從重責(zé)辦”。

侵占沈陽同時， 關(guān)東軍雙管齊下，駐長春 第二師團的長谷旅團下轄的大島第四聯(lián)隊等日軍，對駐長春中國軍隊發(fā)起突然襲擊。中國守軍奮起抵抗，使日軍遭受重創(chuàng)，被打死66人，打傷76人。長春被日本侵占后，9月21日， 關(guān)東軍司令官又命令 第二師團在長春集結(jié)，準(zhǔn)備攻占吉林市。

9月21日晨約6時30分，多門二郎率日軍乘軍用列車從長春向吉林市進犯，但行進遲緩而謹(jǐn)慎，試探性開進。一是因為吉長鐵路線不屬于日本人的“滿鐵”管轄范疇；二是日軍在長春南嶺和寬城子遭到中國守軍激烈抗擊，傷亡慘重而心有余悸。直到 熙洽派遣特使中將參議安玉珍和張燕卿在途中的土門嶺相遇，安玉珍和張燕卿向多門保證吉林市的中國軍隊不會抵抗。甚至表示以生命擔(dān)保，沿途也絕對不會遭致襲擊。多門等日軍首領(lǐng)仍存疑惑，直至下午6時30時左右，這列由火車頭推著的軍列才駛進了吉林省城吉林市。因為一旦途中遇到中國愛國軍隊的武力襲擊，可由倒掛的火車頭牽引，全速逃回長春。

多門二郎及部屬第十五旅團長天野六郎陸軍少將以下800余名日軍官兵，儼然以主子身份走下列車，并合影拍照以示占領(lǐng)了吉林省城吉林市，接著把師團臨時司令部設(shè)在車站附近的名古屋旅館。 在與 熙洽正式會談時，多門以占領(lǐng)者姿態(tài)，命令熙洽在3日之內(nèi)將撤出省城的中國軍隊全部繳械，并立即撤消東北邊防副長官公署和吉林省政府。 熙洽稍有些猶豫，未能馬上應(yīng)允。多門當(dāng)即站起，帶領(lǐng)部下退入別室，只給 熙洽30分鐘考慮時間。 可是，日本官兵10余名隨后便持槍氣勢洶洶闖入室內(nèi)，槍口一齊對準(zhǔn) 熙洽。日本駐吉林總領(lǐng)事古石射也進來游說， 熙洽點頭應(yīng)允多門所提要求。多門這才帶領(lǐng)部下再次進來，彼此握手，還重敘師生之誼（ 熙洽在日本陸軍士官學(xué)校學(xué)習(xí)時，多門曾任中國學(xué)生的區(qū)隊長）。多門從衣兜里掏出清單一張，上有一些原吉林省官吏姓名，多門指示說這些人原則上一律不準(zhǔn)采用。并限制在官銀號提款的數(shù)額，如超過數(shù)額須有 熙洽和多門的共同蓋章，否則不準(zhǔn)支付。

1931年10月30日， 關(guān)東軍下令以 第二師團一部組成 嫩江支隊前往齊齊哈爾，以修橋為名，準(zhǔn)備奪取齊齊哈爾。11月3日至5日， 馬占山部與日軍展開激烈戰(zhàn)斗，使日軍遭受重創(chuàng)。11月6日， 關(guān)東軍決定火速增派 第二師團主力和第三十九混成旅團（屬日本駐朝鮮軍，九一八時，越境支援關(guān)東軍），增援在 嫩江作戰(zhàn)的日軍。11日， 關(guān)東軍又命 第二師團全力向大興方面集結(jié)。到13日， 石原莞爾對 第二師團的出動作出了部署。 17日上午， 關(guān)東軍以 馬占山及黑龍江省軍民沒有按照日軍要求辦理，命令多門師團進攻齊齊哈爾，并將第三十九旅團劃歸多門指揮。18日晨，多門指揮日軍發(fā)動了進攻，日軍先占了三間房，下午又進占了昂昂溪。 本莊繁于18日下午5時30分，給多門發(fā)來了電報：“祝賀貴師團的光輝勝利”。19日晚，多門率 第二師團開進了齊齊哈爾，據(jù)《滿鐵檔案》載，日軍死亡：大興44人；齊齊哈爾附近59人。

1932年1月30日晚8時左右，日軍 第二師團第三步兵旅團（長谷旅團）軍列在雙城被 趙毅為旅長的東北軍第二十二旅突襲，將日軍打得落花流水。但因趙旅未能及時撤出，遭到日軍增援部隊反撲，雙城失陷。

31日深夜，多門不等運送長谷旅的軍列返回，即下令用到達長春的 關(guān)東軍野戰(zhàn)汽車隊，運送第二十九聯(lián)隊等部，于2月1日下午7時30分開赴哈爾濱。 2月2日上午9時， 第二師團主力乘火車北犯。4日，日軍以多門二郎為總指揮，分兩路向哈爾濱發(fā)起進攻。5日下午4時，日軍進入哈爾濱市，多門立即發(fā)布戒嚴(yán)令，并宣布 張景惠為偽哈爾濱特區(qū)行政長官兼?zhèn)魏邶埥�省省長。

2月7日，多門派兵向依蘭方面追擊抗日武裝。22日， 第二師團又奉 關(guān)東軍之命，出兵防止北來進攻的抗日武裝吉林義勇軍，因中東路（屬蘇聯(lián)管轄）不予合作，多門為避免與蘇聯(lián)釀成沖突，下令日軍徒步向一面坡行進。不久，因擔(dān)心解冰期將至，一旦交通斷絕、易遭敗績，而返回了哈爾濱。

早在1931年11月初， 關(guān)東軍參謀部會議上就曾確定對 馬占山采取懷柔手段，企圖利用他來穩(wěn)定黑龍江省的局面，當(dāng)時遭到了馬占山的嚴(yán)詞拒絕。日軍占領(lǐng)省城齊齊哈爾后，又對 馬占山進行誘降。

1931年11月30日，多門二郎致函 馬占山，提出如下條件：⒈馬占山對于克山、泰安鎮(zhèn)的中國軍隊如能勸說使之投降時，可通知新井顧問；⒉馬占山如確定回省，日期亦可通知新井顧問，林少佐親往迎接至泰安鎮(zhèn)亦可；⒊馬占山生命由林少佐擔(dān)保，絕無意外情事；⒋馬占山準(zhǔn)帶衛(wèi)隊80名入城。

江橋抗戰(zhàn)失敗后，形勢日益惡化。1932年2月5日，哈爾濱又失陷，加上漢奸韓云階等人的誘惑， 馬占山在2月7日赴哈爾濱，在“滿鐵公社”面見了多門二郎，在座的還有 土肥原賢二。當(dāng)時隨 馬占山參會談的杜海山的回憶文章記述，情形如下：

多門：“ 馬占山先生此來，事前沒有通知，請將來此的意見告知�！�

馬占山：“因板垣先生上次去 海倫，表示希望和平，并允許江省自治，日本無政治領(lǐng)土野心。我來此即商談江省自治問題，想一切紛爭都可和平解決，故只身前來，以示誠意。希望日方重視諾言，開誠相見。”

多門：“你既只身前來，真是英雄，我皇軍決不小器，扣留或加害你�！�

馬占山：“我只身前來，早把生死置之度外，愿聽貴軍對江省自治的辦法�！�

多門：“江省可以自治，唯須設(shè)日本顧問數(shù)人。”

馬占山：“江省既然自治，不設(shè)顧問，才是名副其實�！�

多門：“馬先生既來此，各事都好辦，江省有馬先生，一切當(dāng)然不能與奉天、吉林一樣辦法，我想本莊司令官亦無異議�！苯又�，多門即囑土肥原以電話請示 本莊繁的意見，少時，土肥原即返回，告知本莊繁的指示。

多門：“本莊司令官已來電話，只要不打戰(zhàn)，諸事都好辦�！�

多門二郎和土肥原臉上都現(xiàn)出喜悅之色，并約 馬占山赴宴。 馬占山欲推辭，并表示：如有懷疑，我愿留在此處。多門和土肥原一齊說：“不要緊，吃過飯再回去，日軍決不懷疑，亦決不作卑鄙無恥的事。”宴請 馬占山的午餐中，多門和土肥原表現(xiàn)出極為客氣。此后，多門繼續(xù)在 關(guān)東軍誘降 馬占山的過程中，起到了重要作用。2月16日， 馬占山乘日軍飛機赴沈陽參加所謂的“四巨頭會議”，24日馬占山就任偽黑龍江省省長之職。

1932年4月15日， 本莊繁又令 第二師團警戒“滿鐵”沿線。12月27日，多門二郎向偽執(zhí)政溥儀告別，30日由沈陽回國。