司馬干字子良，是晉宣帝 司馬懿的兒子，母為宣穆皇后 張春華。 他少年在 曹魏時因為是名臣的兒子被封為安陽 亭侯，逐漸升任撫軍 中郎將， 進封平陽 鄉(xiāng)侯。

咸熙元年（ 264年）， 五等爵制建立，改封司馬干為定陶伯。

泰始元年（ 265年）， 司馬炎代魏建立 西晉，司馬干受封為平原王，食邑一萬一千三百戶，特賜他 鼓吹、 副車之馬二匹及 侍中的服飾。

咸寧三年（277年），司馬炎下詔命沒有官職的諸侯王都回到自己的 封國。但司馬干有無法治愈的間歇性精神病，而他也比較清高，對名利不大感興趣，對情欲感覺比較淡泊，所以司馬炎特別下詔把他留下來。 太康（ 280年—289年）末年，司馬干被拜為 光祿大夫，加侍中，由特賜 金章紫綬，地位僅次于 三公。

永熙元年（290年），晉惠帝 司馬衷即位， 進拜司馬干為 左光祿大夫，侍中如舊，允許佩劍穿鞋上朝，入朝時不用一路小跑。

司馬干雖然被封在大國，但從來不管理封國的事務，封國里有官職調(diào)動，一定以能力來變動。他的官俸和封國的租稅，好像都不是自己的一樣，他的俸祿和 布帛，都因露天堆積而腐爛。陰雨天時就把牛車放在外面而把 露車收回來，有人問他為什么這樣做，司馬干回答說：“露車應該在內(nèi)�！背�臣拜訪他時，就算已經(jīng)通報姓名，司馬干也一定讓他在門外等半天，或者過了一整天都不見。當時能夠得到他接見的賢士，司馬干在與他們應酬接待時，也是恭敬謙遜很溫順的樣子，沒有不正常的地方。他前后的愛妾死去，等到下葬時，一般都把棺釘起來，總把棺槨放在空房子里，幾天打開看一次，奸淫尸體，等到尸體腐壞后才蓋棺下葬。

元康十年（ 300年），趙王 司馬倫輔政，任命司馬干為 衛(wèi)將軍。

永寧元年（ 301年），司馬衷復位，再次任命司馬干為侍中，加職 太保。齊王 司馬冏擊敗篡位的司馬倫，迎接司馬衷復位時，宗室和朝臣都用牛酒來犒勞他，只有司馬干拿著一百錢，告誡司馬冏他說：“趙王謀逆作亂，你能做出正義的舉動，這是你的功勞，現(xiàn)在我拿一百錢來祝賀你。盡管這樣，但在高位上很難坐穩(wěn)，你不可以不謹慎�！彼抉R冏輔政后，司馬干去拜見他，司馬冏親往 迎拜。司馬干入府后，坐在司馬冏的床上，也不叫他坐，只是對他說：“你不要效仿白女兒（指司馬倫）�！�

永寧二年（ 302年）十二月，司馬冏被殺，司馬干知道后非常悲傷的哭泣，對左右的侍從說：“宗室日漸衰微，只有這孩子最優(yōu)秀，又把他殺了，宗室從今以后完了！”

光熙元年（ 306年），東海王司馬越挾持司馬衷，司馬越到洛陽后，前往看望司馬干，司馬干閉門不讓他通報。司馬越在他家門前停車等了很久，司馬干才讓人致歉讓他回去，而自己門縫中偷看司馬越。當時的人都不知道他的想法，有人說因為他有疾病，有人認為他是隱居匿跡。

永嘉五年（ 311年）正月二十二日（2月26日），司馬干去世，享年八十歲。不久后，正逢 劉聰包圍洛陽，所以來不及贈予司馬干 謚號。

房玄齡等《 晉書》：①平原性理不恒，世莫之測。及其處亂離之際，屬交爭之秋，而能遠害全身，享茲介福，其愚不可及已！②文宣孫子，或賢或鄙。...干雖靜退，性乖恒理。

晉宣帝 司馬懿

宣穆皇后 張春華

晉景帝 司馬師

晉文帝 司馬昭

司馬干有二子：

《 晉書·卷三十八·列傳第八》