弗雷德里克二世為丹麥和挪威國王 克里斯蒂安三世之子，母親是薩克森-勞恩堡公爵馬格努斯一世的女兒多羅西亞·馮·薩克森-勞恩堡。與他那謹(jǐn)慎的父親不同，弗雷德里克二世傾向于軍事冒險。他在年輕時代就與德意志那些爭戰(zhàn)不休的王公們過從甚密。即位后，弗雷德里克二世試圖推行加強王權(quán)的改革，遭到強大的丹麥貴族（以國會為代表）的強烈抵制。

弗雷德里克二世在位第一年就發(fā)動對外戰(zhàn)爭，進(jìn)攻位于迪特馬申的一個獨立的農(nóng)民共和國。結(jié)果他成功地將此地征服，取得第一個軍事勝利。不久他又卷入了立窩尼亞戰(zhàn)爭。鑒于立窩尼亞騎士團(tuán)已完全無力抵抗俄國沙皇伊凡四世的猛烈攻勢，弗雷德里克二世于1560年出兵兼并騎士團(tuán)領(lǐng)地薩列馬島，企圖建立緩沖并參與瓜分行將滅亡的騎士團(tuán)的領(lǐng)土立窩尼亞地區(qū)。

弗雷德里克二世統(tǒng)治時期最重要的事件是1563年至1570年與瑞典的戰(zhàn)爭（所謂北方七年戰(zhàn)爭）。瑞典國王埃里克十四世企圖通過戰(zhàn)爭取得在北歐的霸權(quán)，并因此與西班牙結(jié)盟；弗雷德里克二世則想要奪回丹麥在波羅的海地區(qū)的傳統(tǒng)優(yōu)勢。戰(zhàn)爭初期丹麥占據(jù)上風(fēng)，從海上封鎖瑞典，并于1563年攻克瑞典的艾爾夫斯堡要塞。但是瑞典海軍在1565年打破了丹麥的封鎖，侵入霍蘭和斯堪尼亞。戰(zhàn)爭演變成開支巨大的消耗戰(zhàn)，弗雷德里克二世與貴族的關(guān)系急劇惡化。

幸運的是，瑞典內(nèi)部的矛盾阻止了它繼續(xù)打擊丹麥。1568年，埃里克十四世在內(nèi)戰(zhàn)中被其異母弟約翰三世推翻。強有力的丹麥政治家佩德爾·奧克斯穩(wěn)定了丹麥國內(nèi)的局勢，取代弗雷德里克二世掌握了國家權(quán)力。經(jīng)過兩年的艱苦談判，戰(zhàn)爭以一個實際維持戰(zhàn)前狀態(tài)的和約結(jié)束。根據(jù)1570年12月13日簽訂的什切青條約，瑞典贖回艾爾夫斯堡，它的擴張暫時受到遏制。

通過這場戰(zhàn)爭，弗雷德里克二世認(rèn)識到了丹麥軍事能力的有限。他轉(zhuǎn)而開始關(guān)注海上力量。弗雷德里克二世同情宗教改革運動，但也只是在口頭上給以支持而已。弗雷德里克二世曾向英格蘭女王伊麗莎白一世求婚，但在實際處理國際事務(wù)時，他明智地保持中立。有經(jīng)驗的國務(wù)活動家們，如佩德爾·奧克斯，尼爾斯·卡斯和克里斯托弗·瓦爾肯多夫?qū)嶋H上管理著國內(nèi)事務(wù)。

在性格上，弗雷德里克二世是一個魯莽、自負(fù)、好大喜功的人。他熱衷于打獵，喜歡喝酒；許多人相信他最終是死于酗酒。弗雷德里克二世在國內(nèi)建設(shè)上取得一些成果：在1574年~1585年間重建了赫爾辛格的克龍堡城堡；挪威城市 腓特烈斯塔也是他在1576年所建立，并以其名字命名。弗雷德里克二世也是偉大的丹麥天文學(xué)家第谷·布拉赫的資助人。

弗雷德里克二世于1588年去世，遺體安葬在羅斯基勒大教堂。