長(zhǎng)期從事致病菌微進(jìn)化與致病機(jī)制、致病微生物檢測(cè)技術(shù)(生物傳感器和生物芯片)以及微生物法醫(yī)學(xué)。先后承擔(dān)了國(guó)家973計(jì)劃、863計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、重大傳染病防 治重大專項(xiàng)、軍隊(duì)科技攻關(guān)計(jì)劃等幾十項(xiàng)課題，獲軍隊(duì)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)1項(xiàng)，獲中國(guó)發(fā)明專利1項(xiàng)、實(shí)用新型專利4項(xiàng)，發(fā)表SCI學(xué)術(shù)論文100余篇，累計(jì)影響因子超過(guò)300，累計(jì)H因子22，單篇最高影響因子為53.5。2002年獲總后勤部“科技銀星”稱號(hào)，2004年享受軍隊(duì)人才一類津貼；主編《細(xì)菌名稱英解漢譯詞典》、《細(xì)菌名稱雙解及分類詞典》、《生物威脅與核查》、《急性呼吸窘迫綜合征》、《微生物法醫(yī)學(xué)》等6部專著。

國(guó)家衛(wèi)生部疾病防控專家委員會(huì)委員，國(guó)家衛(wèi)生部突發(fā)事件衛(wèi)生應(yīng)急專家咨詢委員會(huì)委員，國(guó)家衛(wèi)生部食品安全委員會(huì)委員，中國(guó)微生物學(xué)會(huì)常務(wù)理事，中國(guó)微生物學(xué)會(huì)分析微生物專業(yè)委員會(huì)主任委員，北京微生物學(xué)會(huì)理事，中國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)微生物生態(tài)專業(yè)委員會(huì)副主任委員等職。并擔(dān)任《微生物學(xué)學(xué)報(bào)》、《解放軍醫(yī)學(xué)雜志》、《解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志》、《生物技術(shù)通訊》、《軍事醫(yī)學(xué)院院刊》等學(xué)術(shù)期刊的編委。

據(jù)2014年8月28日人民網(wǎng)，中央軍委主席習(xí)近平日前簽署通令，給軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院研究員楊瑞馥記三等功。